Connue pour sa biodiversité, la Malaisie abrite 15 000 plantes à fleurs. Cependant, la flore et la faune du pays sont gravement menacées et ont connu un épuisement de 70 pour cent de leur croissance d'origine. Selon la liste rouge de l'Union internationale pour la conservation de la nature (UICN), la Malaisie comptait 686 espèces de plantes menacées en 2007. Les lois malaisiennes protègent les oiseaux, les mammifères et les insectes. La flore et la faune ne sont protégées que si elles poussent dans un parc national ou une réserve.
Les principaux types de forêts en Malaisie sont Giam Kanching ou forêt de diptérocarpacées rare, forêt de mangrove, forêt marécageuse de tourbe et forêt d'éricacées montagnardes, selon le Worldwide Wildlife Fund. L'arbre diptérocarpe, connu pour ses fruits aux graines à deux ailes, pousse sur des terres juste au-dessus du niveau de la mer jusqu'à une altitude d'environ 900 mètres. Les forêts de diptérocarpacées des basses terres, qui se trouvent jusqu'à 300 mètres au-dessus du niveau de la mer, ont été décimées en raison de l'agriculture et d'autres activités gourmandes en terres. Alors qu'une poche d'arbres à diptérocarpacées est protégée dans la réserve forestière de Kanching, cette espèce est considérée comme en danger critique d'extinction - au bord de l'extinction - sur la Liste rouge.
Cette plante tropicale carnivore ne pousse que dans les forêts moussues à une altitude de 2 000 à 2 600 mètres sur le mont Trus Madi à Bornéo. Le Nepenthes macrophylla a des feuilles en forme de pichet qui pendent de vignes de dix mètres de long. Selon l'ASEAN Review of Biodiversity & Environmental Conservation, les insectes glissent du haut cireux de la fleur dans un bassin d'acide sécrété par les glandes de la partie inférieure de la fleur. La Liste rouge de l'UICN a classé le Nepenthes macrophylla comme étant en danger critique d'extinction.
Considérée en danger critique d'extinction sur la Liste rouge, Taxitheliella richardsii est une mousse de la famille des Sematophyllaceae et originaire de Malaisie. La seule zone connue (moins de 10 km²) où la mousse a été trouvée se trouve au Sarawak, un état malais au nord-ouest de Bornéo. Taxitheliella richardsii pousse sur des vignes ligneuses et des troncs pourris dans les forêts subtropicales, un habitat en voie de disparition à cause de la récolte du bois et de l'exploitation forestière.