L'écosystème marin est soumis à un stress sévère; dans de nombreuses régions, les conditions nécessaires au maintien de la vie sont soit menacées, soit inexistantes. La destruction des habitats marins est particulièrement répandue le long des côtes où les populations humaines ont augmenté. Perte d'habitat, pollution, surpêche, pratiques de pêche destructrices et réchauffement climatique mettent tous en péril l'environnement marin.
Littoral
La perte d'habitat, la pollution, le ruissellement et l'augmentation de la salinité détruisent les récifs coralliens, les herbes marines et d'autres habitats pour les oiseaux et les poissons. À mesure que les zones humides côtières sont comblées pour accueillir des populations humaines croissantes, la construction de barrages sur les rivières diminue le débit d'eau douce, ralentit le ruissellement des nutriments et inhibe la migration des poissons. Moins d'eau douce signifie une salinité accrue dans les zones humides et les estuaires, ce qui nuit aux herbes qui purifient l'eau lorsqu'elle s'écoule vers la mer. L'érosion causée par la déforestation envoie du limon dans les rivières, les ruisseaux et finalement l'océan, bloquant la lumière du soleil nécessaire à la survie des récifs coralliens.
Surpêche
Le rendement maximal durable est calculé par les biologistes des pêches pour estimer la quantité de poisson qui peut être récoltée dans une population sans risquer sa viabilité à long terme. Entre 1974 et 1999, la proportion de pêcheries qui ont dépassé le rendement maximal durable pour la morue a triplé, passant de 10 pour cent à 30 pour cent. Selon le Center for Ocean Solutions, depuis le début des années 90, les captures totales dans l'un des pays les plus pêche productive, la mer d'Okhotsk, a diminué entre deux et deux fois et demie en raison de surpêche. Dans l'océan Pacifique, plus de la moitié des nations insulaires ne gèrent pas durablement leurs récifs coralliens.
Fond marin
Utilisant une pratique connue sous le nom de chalutage de fond, les bateaux de pêche commerciale traînent de grands filets attachés à des poids lourds sur le fond marin. Les espèces ciblées comprennent la crevette, la morue, la sole et la plie, mais tout le long du fond marin est capturé. Le chalutage de fond peut endommager de façon permanente l'écosystème marin et les prises accessoires (espèces non ciblées comme les tortues de mer, les oiseaux de mer et les mammifères) sont simplement jetées par-dessus bord. Les prises accessoires peuvent représenter 90 % des prises totales et les poissons en voie de disparition et les coraux des grands fonds sont souvent tués.
Acidification
À mesure que le climat se réchauffe, l'océan absorbe plus de dioxyde de carbone, ce qui le rend plus acide. L'acidité accrue inhibe la capacité des organismes marins à développer des coquilles, et cela inclut les minuscules animaux appelés plancton qui forment la base de la chaîne alimentaire de l'océan. Certains chercheurs suggèrent que cela amènera également certaines espèces marines à émettre moins de composés soufrés qui favorisent la formation de nuages, ce qui refroidit la Terre. Les modèles climatiques prédisent que cela entraînera un réchauffement supplémentaire de 0,5 degré Celsius (0,28 degré Fahrenheit) au cours de ce siècle.