Maapallolla aurinkoenergia ajaa tuulet; joten Neptunuksessa, jossa aurinko ei näytä olevan paljon suurempi kuin tähti, voit odottaa heikkoa tuulta. Kuitenkin päinvastoin. Neptunuksella on voimakkaimmat pintatuulet aurinkokunnassa. Suurin osa näiden tuulien polttoaineesta tulee planeetalta itseltään.
Mihin tahansa kaasun jättiläisplaneettaan verrattuna maapallon ilmakehä on tyyneyden uima-allas. Jupiterilla Punaisen Pisteen tuulet nousevat 618 kilometriin tunnissa (384 mailia tunnissa), mikä on melkein kaksi kertaa nopeammin kuin tuulet kovimmalla maan hurrikaanilla. Saturnuksessa ylemmän ilmakehän tuulet voivat puhaltaa melkein kolme kertaa kovempaa kuin nopeus 1800 kilometriä tunnissa (1118 mailia tunnissa). Jopa nämä tuulet ovat takaistuimessa lähellä Neptunuksen Suuren tumman paikan lähellä olevia tähtiä, joiden tähtitieteilijät ovat arvioineet 1931 kilometriä tunnissa.
Kuten Jupiter ja Saturnus, Neptunus tuottaa enemmän energiaa kuin aurinko saa, ja tämä planeetan ytimestä säteilevä energia ajaa voimakkaat pintatuulet. Jupiter säteilee sen muodostumisesta jäljellä olevaa energiaa, ja Saturnuksen säteilemä energia on suurelta osin seurausta heliumsateen aiheuttamasta kitkasta. Neptunuksessa metaanivaippa - joka on kasvihuonekaasu - vangitsee lämmön. Jos planeetta olisi kuin Uranus (josta puuttuu sisäinen energialähde), tuo lämpö olisi säteillyt avaruuteen kauan sitten. Sen sijaan, vaikka lämpötilat ovat kylmät, planeetta säteilee 2,7 kertaa enemmän lämpöä kuin se saa auringolta, mikä riittää ajamaan sen raivokkaat tuulet.