Kaksisäikeisen DNA: n rakenne on yleinen kaikissa elävissä soluissa, mutta eroja esiintyy menetelmissä genomisen DNA: n uuttamiseksi eläin- ja kasvisoluista. Vaikka genominen DNA elää solujen ytimessä, uutetun DNA: n määrä ja puhtaus riippuvat solun tyypistä ja koosta. Esimerkiksi tietyt solut sisältävät enemmän DNA: ta ja epäpuhtauksia kuin toiset. Lue lisää saadaksesi lisätietoja DNA-uuttoeroista.
Yleinen DNA-uutto
Jos käsittelet kasvi- ja eläinsoluja saippualla, se hajottaa lipidejä solussa ja ydinkalvoissa. Sitten DNA-seos erottuu solukalvoista ja proteiineista. Seuraavaksi voit käyttää alkoholia saostamaan liuoksessa olevan DNA: n. Näytteessä olevasta määrästä riippuen DNA voi olla näkyvissä paljaalla silmällä. Muista kuitenkin, että tämä yksinkertainen menettely ei välttämättä tuota erittäin puhdasta DNA: ta.
Kasvien ja eläinten solut
Kasvisolut eroavat eläinsoluista jäykän soluseinän ja kloroplastin kaltaisten organellien vuoksi. Ne sisältävät myös proteiineja ja entsyymejä, joilla on rooli fotosynteesissä. Joillakin kasvisoluilla on polyploidia, mikä tarkoittaa, että niillä on enemmän kuin yksi kopio kustakin kromosomista solua kohden. Lisäksi kasveissa esiintyvät soluprosessit, kuten fotosynteesi, tuottavat erilaisia sekundaarisia metaboliitteja. Eläinsoluilla ei ole soluseinää, mutta ne silti tarvitsevat kemikaaleja, kuten natriumdodekyylisulfaattia (SDS) solukalvon hajottamiseksi genomisen DNA: n vapauttamiseksi.
Kasvien DNA-uutto
Kasvien genomista DNA: ta on vaikeampaa erottaa kasvin soluseinän takia. Voit poistaa sen homogenisoimalla tai lisäämällä sellulaasia soluseinän muodostavan selluloosan hajottamiseksi. Lisäksi kasvisolussa olevat metaboliitit voivat häiritä genomisen DNA: n uuttamista saastuttamalla DNA-näytteen saostusprosessin aikana.
Eläinten DNA-uutto
Perifeerisen veren leukosyytit ovat tärkein eläingenomisen DNA: n lähde, mutta näytteiden kerääminen on vaikeaa, koska veren on oltava peräisin suoraan eläimestä. Veri sisältää useita yhdisteitä, kuten proteiineja, lipidejä, valkosoluja, punasoluja, verihiutaleita ja plasmaa, jotka voivat saastuttaa DNA-näytteen. Verinäytteistä uutetun eläin-DNA: n ensisijainen epäpuhtaus on kuitenkin hemiä, joka on hemoglobiinin ei-proteiinikomponentti.
DNA-erot
Kasvien ja eläinten DNA: n erot ovat emäksisekvenssissä heliksissä. Kasvisoluista löydettyjä yhdisteitä puuttuu eläinsoluista, ja DNA-emässekvenssit heijastavat tätä. Myös genomisen kasvin DNA on usein suurempi kuin eläin-DNA. Nämä erot vaikuttavat myös uuttomenetelmiin, saantoon ja DNA: n puhtauteen.