Vaikka niitä ei voida nähdä paljaalla silmällä, bakteereja on kaikkialla. Niitä on elintarvikkeissa, maaperässä, vedessä, kodeissamme olevilla pinnoilla sekä kehossamme ja kehossamme. Bakteereja esiintyy yleensä sekapopulaatioissa. Tietyn bakteerin eristäminen muista bakteerilajeista tietyssä näytteessä antaa mikrobiologien tutkia sen rakennetta ja toimintaa, sen tunnistamisessa käytettyjä ominaisuuksia. Mikrobiologit eristävät bakteereja usein käyttämällä yhtä monista juovalevytekniikoista.
Työkalut
Inokulointisilmukkaa käytetään mikro-organismien siirtämiseen. Se koostuu nikromi- tai platinalangasta, jonka toisessa päässä on pieni pyöreä silmukka. Toinen pää on suora ja liukuu kahvaan. Saatavana on myös muovisia kertakäyttösilmukoita. Bakteerit voidaan eristää vain, jos ne kasvavat. Mikrobiologit kasvattavat bakteereja putkilevyjen eristämiseksi matalissa, pyöreissä petrimaljoissa, jotka on täytetty kiinteällä väliaineella, jota kutsutaan agariksi. Agar jäljittelee ympäristöä, jossa bakteerit luonnollisesti kasvavat. Elatusaineella täytetyt astiat ovat steriilejä ja kannet ei-toivottujen organismien kasvun estämiseksi. Viipalevyn eristämisen aikana rokotuspiiri steriloidaan toistuvasti Bunsen-polttimen liekissä.
Periaate
Putkilevytekniikka on suosituin menetelmä tiettyjen bakteerien eristämiseksi näytteestä, joka sisältää mikro-organismien seosta. Tekniikka laimentaa olennaisesti organismien määrää ja vähentää niiden tiheyttä. Sen avulla mikrobiologit voivat erottaa ja eristää yksittäiset bakteeripesäkkeet. Siirtomaa on näkyvä bakteeriryhmä. Kaikki yhden pesäkkeen bakteerit ovat peräisin samasta bakteerisolusta. Näin ollen yksittäiset pesäkkeet ovat ”puhtaita” pesäkkeitä. Puhdas siirtomaa siirretään toiselle levylle puhtaan viljelmän tuottamiseksi, joka koostuu yhden tyyppisistä bakteereista.
Menettely
Kun se tehdään oikein, putkilevyn eristäminen ohentaa näytteen ja antaa yksittäisille bakteerisoluille mahdollisuuden kehittyä eristetyiksi pesäkkeiksi. Mikrobiologi aloittaa steriloimalla rokotussilmukan liekissä. Hän jäähdyttää silmukan koskettamalla sitä agariin, kastaa sitten silmukan näytteeseen ja levittää sitä edestakaisin peittämään osan levystä. Hän steriloi silmukan, jäähdyttää sen ja ympää toisen vierekkäisen osan levystä vetämällä silmukka ensimmäisen osan läpi useita kertoja ja peittää toisen osan siksakilla liike. Tämä poimii pienen määrän bakteereja ensimmäisestä osasta ja siirtää ne toiseen osaan. Kuinka monta kertaa tämä perusmenetelmä toistetaan, riippuu käytetystä putkilevymenetelmästä. Menetelmästä huolimatta alkuperäistä näytettä käytetään vain levyn ensimmäisen osan ymppäämiseen.
Viivalevymenetelmä
Viivalevymenetelmät vaihtelevat raidoitettujen agar-osien lukumäärän mukaan. T-putkimenetelmässä käytetään kolmea osaa: ylempi puoli ja kaksi yhtä suurta alaosaa. Alkuperäinen rokote asetetaan levyn yläosaan. Bakteerit vedetään yläosasta yhteen alaosasta ja sitten siitä alaosasta toiseen. Neljännesmenetelmässä neljä yhtä suurta osaa on raitoja. Jatkuvassa juovutusmenetelmässä siirrostetaan tyypillisesti levyn yläosa, kiertämällä sitä 180 astetta, ja siirrostetaan levyn toinen puoli steriloimatta silmukkaa tai vetämättä bakteereja edellisestä -osiossa.