Deoksiribonukleiinihapon - DNA: n - rakenteen osoitettiin olevan kaksinkertainen helix vuotta sitten, mutta jokaisen juosteen nimeämiskäytännöstä on tullut sekaannusta sekä tutkijoille että opiskelijoille. DNA-parien joukosta toista kutsutaan Watsoniksi ja toista Crickiksi kahden DNA: n löydön jälkeen. Mutta tieteellinen kirjallisuus on eri mieltä siitä, mihin säikeeseen tulisi antaa mikä nimi. Watson-Crick-nimijärjestelmän oli tarkoitus osoittaa DNA-rakenteessa kunkin juosteen erilliset toiminnalliset ominaisuudet, mikä on muiden nimitysjärjestelmien sama tavoite. On tärkeää ymmärtää eri kontekstit, joissa yksittäisten säikeiden on omaksuttava eri nimet. Kaksi täydellistä esimerkkiä ovat niiden erilaiset roolit DNA-replikaatiossa tai transkriptiossa. Tietäen, mitä kukin säie tekee biologisessa prosessissa, voidaan selvittää, miksi sille annettiin tuo nimi.
Tunteeton ei ole hölynpölyä
Transkriptio on prosessi, jolla DNA kopioidaan RNA: ksi. Se tapahtuu entsyymillä, jota kutsutaan RNA-polymeraasiksi (RNA Pol). RNA Pol lukee vain yhden kahdesta DNA-juosteesta, kun se tekee RNA-molekyylistä. Kaksisäikeinen DNA-molekyyli hajoaa toisistaan ja RNA Pol sitoutuu yhteen juosteeseen, jonka se lukee ja kopioi. Tätä juosetta kutsutaan templaattisäikeeksi tai anti-sense-juosteeksi. Tuotettu RNA-molekyyli on komplementaarinen templaattisäikeelle, mikä tarkoittaa C: n nukleotideja templaattijuoste ja RNA-molekyyli sopivat toisiinsa sääntöjen mukaisesti: adeniini urasiiliin ja guaniini sytosiini.
Tämä on järkeä
Kun RNA: ta transkriptoidaan DNA: sta, RNA-polymeraasi sitoutuu ja kopioi templaattisäikeeseen. Jäljellä olevaa juosetta kutsutaan koodaavaksi juosteeksi (katso viite 5) tai sense-juosteeksi. Ottaen huomioon nukleiinihappojen emäspariliitossäännöt (A-parit T: n kanssa ja G-parit C: n kanssa), DNA: ta koodaavalla tai sense-juosteella on identtinen sekvenssi tuotetulla RNA: lla. Poikkeuksena on, että RNA sisältää nukleotidin U (urasiili) T: n (tymiinin) sijasta, jotka molemmat muodostavat parin A: n (adeniini) kanssa.
Tasainen kyyti
Ennen mitoosia tai solujen jakautumista solun on replikoitava DNA: nsa niin, että jokaisella tytärsolulla on sama määrä DNA-säikeitä. DNA-polymeraasi on entsyymi, joka kopioi pitkät DNA-jaksot useampaan DNA: han. Replikaatiohaarukassa DNA-molekyyli purkautuu muodostaen kuplan, johon polymeraasi liukuu. Polymeraasi sitoutuu kelautumattoman DNA: n molempiin säikeisiin ja alkaa kopioida molemmat säikeet. Yksi kopioista tehdään yhtenä yhtenäisenä säikeenä, johon viitataan johtavana säikeenä. DNA-replikaatio on toinen tapaus, jossa DNA-säikeillä on eri nimet.
Pysäytä ja mene -liikenne
DNA-tikkaiden anti-rinnakkainen rakenne tarkoittaa, että yksi juoste kulkee päästä hännään, kun taas toinen juoste kulkee hännästä päähän. DNA-replikaation aikana DNA-polymeraasin on luettava ja kopioitava molemmat säikeet samanaikaisesti, vaikka ne kulkevat vastakkaisiin suuntiin. Koska DNA-polymeraasi pystyy lukemaan ja kopioimaan DNA-säikeitä vain yhteen suuntaan - hännän päähän - juosteeseen että Polymerase-kohtaamisia, jotka on suunnattu päähän asti, ei voida lukea ja kopioida yhtenä yhtenäisenä säie. Tämä päähän-häntä-juoste kopioidaan lyhyinä fragmentteina, joita kutsutaan Okazaki-fragmenteiksi ja jotka fuusioidaan myöhemmin muodostamaan yksi pitkä juoste. DNA-replikaatiossa siru, joka muodostuu fragmentteina, kutsutaan jäljessä olevaksi juosteeksi.