Mississippi-joella asuu erilaisia vesikasveja ja eläimiä monimutkaisessa, toisiinsa yhteydessä olevassa ekosysteemissä. Vesikasvit tarjoavat ruokaa ja suojaa joen monille eri lajeille, ja ne voivat olla yhtä pieniä kuin yksisoluiset levät. Mississippi-joella on erilaisia eläimiä selkärangattomista kaloihin, sammakkoihin ja muihin.
Levät
Iowan luonnonvaraministeriön mukaan Mississippi toimii isäntänä kahdelle tärkeälle levätyypille: vihreälle ja sinivihreälle. Vihreät levät ovat minkä tahansa terveellisen ekosysteemin biologinen peruskomponentti; ne luovat suuria pesäkkeitä, jotka voivat antaa vedelle vihertävän valun. Sinilevät ovat vähemmän toivottavia, ja niitä pidetään haitallisena levänä. Ne liittyvät stressaantuneisiin ekosysteemeihin ja voivat aiheuttaa epämiellyttäviä makuja kaloissa tai tappaa kokonaiset populaatiot.
Duckweed
Tällä tavallisella vapaasti kelluvalla kasvilla on yksi pieni lehti ja juuret, jotka roikkuvat vedessä imemään ravinteita. Kuten nimensä osoittaa, ankka on tärkeä ravinnonlähde monille vesilinnuille.
Vesililjat
Valkoiset vesililjat ovat yleinen paikka Mississippi-joessa, ja ne koostuvat suurista, kelluvista lehdistä, joissa on nahkainen rakenne. Ne tuottavat suuria valkoisia kukkia lehtien päälle ja juurtuvat alla olevaan mutaan.
Rapuja
Nämä äyriäiset, joita kutsutaan myös languiksi tai langusteiksi, muistuttavat pieniä hummeria. Ne ovat pääasiassa pohja syöttölaitteita, ja ne kuluttavat vuotoja muilta eläimiltä, ruholta ja pieniltä eläimiltä. Sekä kotoperäiset että invasiiviset raput elävät Mississippi-joessa.
Monni
Kanavan monni ovat yleinen näky Mississippi-joella. Ne ovat lukuisimpia monni-tyyppejä. Nämä kalat voivat kasvaa yllättäviksi koiksi ja tarttua ensisijaisesti joen pohjaan. He ovat merkittäviä taipumuksellaan iskeä monenlaisiin syötteihin, mutta niitä tulisi syödä harvoin PCB (polykloorattu bifenyyli) -saastumisen vaaran vuoksi.
Leopard sammakko
Näitä täplikkäitä sammakoita kutsutaan myös niitty-sammakkoiksi. He asuvat Mississippi-joella ja sen ympäristössä. Ne toimivat usein ympäristöindikaattorilajina, koska ne ovat alttiita epäpuhtauksille ja epäpuhtauksille. He viettävät suurimman osan ajastaan purojen ja muiden vesistöjen reunalla ja syövät enimmäkseen hyönteisiä, niveljalkaisia ja muita selkärangattomia.