Hyvin harvat bakteerit tuottavat endosporeja. Vain osa Firmicute-suvun lajeista tuottaa endosporeja, jotka ovat ei-lisääntymisrakenteita, jotka sisältävät DNA: ta ja osan sytoplasmasta. Endosporit eivät ole todellisia itiöitä, koska ne eivät ole bakteerin jälkeläisiä. Endosporit muodostuvat, kun bakteerit ovat äärimmäisissä tai epäsuotuisissa ympäristöolosuhteissa. Ne voivat selviytyä pitkiä aikoja, vaikka ne olisivat nälkään ruokaa ja altistuvat kemikaaleille ja lämpötiloille, jotka normaalisti tappavat bakteerit.
Bacillus-bakteerit
Bacillus-suvun bakteereja tutkitaan yleisimmin kaikista endosporeja tuottavista bakteereista. Bacillus-bakteerit ovat erilaisia ja menestyvät monissa eri ympäristöissä. Tämän bakteerin endosporit ovat erittäin myrkyllisiä monille organismeille, myös ihmisille. Taudinaiheuttaja Bacillus anthracis on tunnettu toksiini, jota ovat käyttäneet sekä tutkijat että terroristit. Bacillus-lajeja on kuitenkin monia muita.
Clostridium-bakteerit
Kuten muutkin endosporeja tuottavat bakteerit, Clostridium-bakteerit ovat gram-positiivisia, mikä osoittaa, että niillä on samanlaiset ominaisuudet, kuten soluseinärakenne. Grampositiiviset bakteerit ovat herkkiä samoille tai läheisesti läheisille antibiooteille. Clostridium-suvun bakteerit ovat vastuussa monenlaisista ihmissairauksista aina lievästä ruokamyrkytyksestä botulismiin sekä tetanukseen ja kaasugreeniin.
Desulfotomaculum-bakteerit
Kuten muutkin endosporeja tuottavat bakteerit, myös Desulfotomaculum-suvun bakteerit ovat vastuussa ruoan pilaantumisesta ja sairauksista. Desulfotomaculum-bakteerit voivat aiheuttaa huonosti purkitettujen elintarvikkeiden pilaantumisen. Siellä missä niitä on runsaasti, ne tuottavat epämiellyttävän rikkimaista hajua.