Seened on mikroskoopilised rakud, mis kasvavad tavaliselt pikkade niidide või kiududena, mida nimetatakse hüüfideks, mis sunnivad oma teed mullaosakeste, kivimite ja juurte vahel. Need on tihedalt seotud loomade ja taimedega ning on olnud umbes umbes miljard aastat. Inimesed jagavad umbes 80 protsenti oma geenidest seentega, see tähendab, et teie naabril ja teie aia seenel võib olla rohkem ühist, kui silma paistab.
Maailmas on tuvastatud vähemalt 70 000 erinevat mullaseeneliiki. Need võib taksonoomiliselt jagada nelja rühma: Zygomycota, Ascomycota, Basidiomycotaja Deuteromycota. Igapäevastel vaatlejatel on neist ehk lihtsam mõelda nende funktsiooni ja metaboolsete omaduste osas.
Saprofüütilised seened
Saprofüütilised seened on lagundajad. Seenesaprofüüdid lagundavad energia saamiseks mullas leiduvat tselluloosi ja ligniini. Selle protsessi metaboolsete kõrvalproduktide hulka kuuluvad süsinikdioksiid ehk CO2ja väikesed molekulid nagu orgaanilised happed; osa neist metaboliitidest võivad õigetes tingimustes ümbritsevas pinnases püsida tuhandeid aastaid.
Saprofüütsed seened võivad kasvada väga erinevates kohtades, kuna aineid, millest nad toitu saavad, on laialt levinud. Mõnda saprofüütset seent nimetatakse "suhkruseenteks", kuna nad kasutavad samu substraate nagu paljud bakterid.
Vastastikused seened
Mutualistlikke seeni nimetatakse ka mükoriisaseenideks. Need mullaseened koloniseerivad taimejuuri ja neid nimetatakse "vastastikusteks", kuna seened saavad taimede olemasolust kasu ja vastupidi. Vastutasuks taime süsinikuaatomite eest aitavad mükoriisaseened taimedel fosforit hõlpsamalt sisse tõmmata ja nad toovad taimedesse, millel nad asuvad, ka muid mullatoitaineid, sealhulgas lämmastikku, mikrotoitaineid ja vett ankurdatud.
Mutualistlikud seened hõlmavad kahte suurt rühma. Üks neist on ektomükoriisad, mis kasvavad taimejuurte pinnal ja mida sageli nähakse puudel või nende lähedal. Teine suurem rühm, endomükoriisad, kasvavad taimejuurrakkudes, mitte aga sees, ning on tavaliselt seotud rohttaimede, ridadena kasvatatavate põllukultuuride, köögiviljade ja igapäevaste põõsastega.
Patogeensed seened
Nimetatud seened, mida nimetatakse ka parasiitseteks seenteks, põhjustavad selgelt vastandatuna intervallalistidele taimekasvatuse vähenemist või isegi taimede surma, kui nad koloniseerivad juuri või muid mullaorganisme. Juurepatogeensed seened põhjustavad inimeste põllumajanduslikes ettevõtmistes suuri majanduslikke kahjusid aastas. Paljud neist seentest võivad aga korralikul kasutamisel aidata haigusi kontrolli all hoida. Näiteks parasiteerivad nematoode püüdvad seened haigusi põhjustavaid nematoode ehk ümarussid, samas kui putukatelt energiat saavad seened võidakse kasutada kahjuritõrjevahenditena.
,