Inimesed toetuvad toidu ja muu inimese tervislikuks eluks vajaliku varustamiseks ökosüsteemidele. Teatud inimtegevused on ökosüsteemidele siiski hävitavalt mõjunud. Saastest kuni ülejaotamiseni on eluslooduse ja loodusliku taimestiku kahjustamine ja kasutamine inimeste poolt jätnud mõned ökosüsteemid halvas seisukorras.
Ökosüsteemi reostus
Paljud industrialiseerimise kõrvalsaadused on kahjustanud ökosüsteeme. Näiteks söe põletamisel energia tootmiseks eraldub kemikaale nagu vääveldioksiid. Sellised õhus olevad kemikaalid põhjustavad happevihmasid ja hapete sadestumist, mis võib kahjustada taimede ja loomade elu, eriti kuna see hapestab veeökosüsteeme. Lisaks võib inimtegevusest tulenev vedel keemiline äravool negatiivselt mõjutada ökosüsteeme. Sellist äravoolu ei tooda mitte ainult suured tööstuslikud tehased. Elamupiirkondade muru, sissesõiduteede ja kõnniteede tsingi ja plii äravool võib kahjustada ökosüsteeme.
Linnade laienemine
Linnade laienemine on linnade üha suurem levik varem maapiirkondadesse. Linnastumise tõuke maapiirkondadesse mahutamiseks on toimunud lageraie ja raadamine. Lisaks metsa ja muu taimestiku kadumisele viivad sellised toimeained elupaikade killustumiseni. Kui teed, kodud või isegi sõidukid lõikavad ökosüsteemi algse koosseisu, võib loomad ära lõigata suurest osast nende elupaigast ja lisaks ka nende populatsioonist.
Invasiivsete liikide tutvustamine
Liikide ülekandmine võib olla tahtmatu, näiteks taime spoor haakub jalanõuga. Või võiks uue liigi sissetoomine olla tahtlik, nagu see oli Aasia karpkala puhul Ameerika Ühendriikides. Riikliku loodusliku loomaliidu andmetel ohustavad võõrliigid 42 protsenti ohustatud loomadest. Need liigid kujutavad endast probleemi, kuna nad konkureerivad toidu pärast ega pruugi olla kohalike liikide jaoks hea toit. Lisaks võivad invasiivsed liigid vähendada bioloogilist mitmekesisust ja füüsiliselt muuta ökosüsteemi. Näiteks võib invasiivne liik muuta mulla keemilist koostist.
Ökosüsteemide ülejagamine
Liigne saak, mida mõnikord nimetatakse ülepüügiks, toimub siis, kui liigid võetakse nende looduslikust elupaigast. See võib juhtuda elupaikade hävitamise tagajärjel, kuid sagedamini on see tingitud jahist või kalastamisest. Sellist jätkusuutmatut tegevust võib eriti täheldada kalatööstuses, kus selliste liikide nagu turska, kilttursa ja lesta populatsioon on drastiliselt vähenenud. Liigne koristamine võib põhjustada ökosüsteemide tasakaalustamatust, häirida toiduahelat ja kahjustada muid koristamata liike.
