Ökosüsteeme on palju erinevaid. Veeökosüsteemid moodustavad suure osa maailma ökosüsteemidest ja neid võib klassifitseerida kas mageveeökosüsteemideks või mereökosüsteemideks. Igasuguse ökosüsteemi elanikud kohanduvad ellujäämisega selle ökosüsteemi antud tingimustes.
Ökosüsteem on kooslus, mida hoiavad kokku antud piirkonna biootiliste ja abiootiliste tegurite keerulised koostoimed. Ökosüsteemi biootilised tegurid on elusad osad nagu taimed, loomad, bakterid ja seened. Abiootiliste tegurite hulka kuuluvad muld, vesi ja muud keskkonnas esinevad eluta elemendid. Ökosüsteem võib olla nii suur kui kõrb või väike kui mõõna bassein. Elusolendeid on ainult nii palju, kui toiduvarud seda toetavad. Sellised koostoimed nagu kiskja-saak ja toiduvõrgu suhted määravad ökosüsteemi populatsiooni. Igal elusolendil on täita oma roll, mis aitab kaasa ökosüsteemi üldisele edukusele ja ellujäämisele.
Mõiste mere tähistab ookeanidega seotud ökosüsteemi. Keskkonnakaitseagentuuri (EPA) andmetel moodustavad mereökosüsteemid umbes 70 protsenti maailma ökosüsteemidest. Mereökosüsteemid on ainulaadsed vees suspendeeritud lahustunud ühendite, eriti soola tõttu. Erinevad mereökosüsteemide tüübid elavad nii väikeste kui mikroskoopilise planktoni ja vaalade suuruste organismidega. Mereökosüsteemide hulka kuuluvad ookeanid, suudmealad ja soolased sood, korallrahud, mangroovimetsad, laguunid, pruunvetikas mererohu sängid ja rannikutele ulatuv loodete vöönd.
Magevee ökosüsteeme on palju. Jõed, järved, tiigid ja ojad on kõige tavalisemad mageveeallikad. Veehoidlaid, märgalasid ja põhjaveeallikaid peetakse ka mageveeökosüsteemideks. Mageveeökosüsteemid ei sisalda vees samu lahustunud aineid kui mereökosüsteemid, seega ei elaks seal elavad loomad ja taimed mereökosüsteemis ellu. Kuna magevesi ei sisalda soola, on see külmumisele ja sulatamisele vastuvõtlikum. Mageveetaimed ja loomad on selle protsessi üleelamiseks kohanenud. Neil on ka spetsiaalselt magevee jaoks kohandatud hingamisteede struktuurid ning neil on välja arenenud paljunemis- ja toitumiskäitumine, mis võimaldab neil oma keskkonnas edukalt ellu jääda.
