Tsentrifuug on seade, mis koosneb kambrist, mis pöörleb keskteljel. Pöörlev liikumine põhjustab materjalide eraldumise nende erineva raskuse alusel. Tsentrifuugi rootor on tsentrifuugi pöörlev seade, millel on nurga all puuritud fikseeritud augud. Katseklaasid asetatakse nende aukude sisse ja rootor pöörleb materjalide eraldamise hõlbustamiseks. Tsentrifuugrootoreid on kolme tüüpi: pöördkopp, fikseeritud nurga all ja vertikaalselt rootorid.
Pöördkopaga rootor toetab tavaliselt proove vahemikus 36 ml kuni 2,2 ml. Swing-buckets võib toetada kahte tüüpi eraldusi: rate-zonaalne ja isopycnic. Kiirus-tsoonide eraldamise korral on eelistatud kiigekopad, kuna meniski väliskülje ja toru põhja väliskülje vaheline kaugus on eraldamiseks piisavalt pikk.
Fikseeritud nurga all olevaid rootoreid kasutatakse tavaliselt graanulite valmistamiseks suspensiooni osakeste graanulite eemaldamiseks ja üleliigse prahi eemaldamiseks või pelleti kogumiseks. Rootori õõnsused jäävad vahemikku 0,2 ml kuni 1 ml. Fikseeritud nurga rootori kasutamise otsustamisel on kõige olulisem aspekt K-tegur. K-tegur näitab, kui tõhusalt saab rootor pelletida maksimaalsel kiirusel. Mida väiksem on K-tegur, seda suurem on granuleerimise efektiivsus.
Vertikaalsed rootorid on väga spetsialiseerunud. Neid kasutatakse tavaliselt tseesiumkloriidi DNA sidumiseks. Vertikaalsetes rootorites on K-tegurid väga madalad, mis on kasulik, kui osake peab pelletiks liikuma vaid väikese vahemaa tagant. Vertikaalsete rootorite tööaeg on lühike.