El nitrógeno es un elemento que se encuentra en todas las proteínas y es esencial para la vida vegetal y animal. El nitrógeno gaseoso en el aire tiene que ser fijado en compuestos, ya sea por rayos o por bacterias que habitan en el suelo, antes de que pueda ser utilizado por las plantas. Estos compuestos incluyen amoniaco y nitratos. Los animales pueden absorber nitrógeno al comer plantas. Cuando la materia viva muere o los desechos que contienen nitrógeno se excretan, las bacterias y los hongos vuelven a convertir el nitrógeno orgánico en amoníaco.
Bacterias Nitrobacter
Todas las especies de bacterias del suelo que convierten los nitritos en nitratos pertenecen al género Nitrobacter. Hay cuatro especies identificadas: Nitrobacter winogradskyi, Nitrobacter hamburgensis, Nitrobacter agilis y Nitrobacter alkalicus. En 2007, un estudio filogenético del género Nitrobacter, publicado en "Systematic and Applied Microbiology", identificó 30 cepas diferentes para algunas de las especies. Nitrobacter existe en suelos y agua dulce donde el pH es moderado. No crece en hábitats muy ácidos.
Bacterias Nitrosomonas
Las especies de bacterias Nitrobacter suelen aparecer junto con las bacterias del género Nitrosomonas en comunidades bacterianas mixtas llamadas consorcios. Los dos tipos de bacterias son codependientes, ya que Nitrosomonas produce los nitritos que Nitrobacter necesidades, y Nitrobacter limpia los nitritos que pueden suprimir las Nitrosomonas si se permite que se acumule arriba.
Bacterias marinas
En el océano, hay dos tipos adicionales de bacterias que oxidan los nitritos en nitratos. Estos son Nitrococcus mobilis y Nitrospina gracilis. Nitrococcus mobilis, aislado de las aguas del Pacífico Sur, es un gran coco móvil con membranas celulares tubulares únicas. Nitrospina gracilis es larga, delgada y con forma de varilla, sin un extenso sistema de membrana celular. La nitrospina se ha vuelto comercialmente disponible para las personas que mantienen acuarios de agua salada, para ayudar a mantener bajos los niveles de nitrato en el agua del tanque. Las bacterias ayudan a oxidar los nitritos tóxicos que producen los peces.