Οι κοραλλιογενείς ύφαλοι είναι οι ασβεστοποιημένες θαλάσσιες δομές που σχηματίζονται από τους εξωσκελετούς των κοραλλιών και τα τρία κύρια είδη φυτών που αλληλεπιδρούν με τους κοραλλιογενείς υφάλους είναι φύκια, φύκια και μαγγρόβια, με τα φύκια να χωρίζονται σε κόκκινο και πράσινο ποικιλίες. Πολλά από αυτά τα θαλάσσια φυτά ωφελούν τους κοραλλιογενείς υφάλους. Τα οικοσυστήματα κοραλλιογενών υφάλων περιλαμβάνουν επίσης ένα ευρύ φάσμα πανίδας και είναι μερικά από τα πιο ζωντανά οικοσυστήματα της Γης.
Κόκκινα άλγη και κοραλλιογενείς υφάλους
Ένας ορισμένος τύπος κόκκινων φυκών που ονομάζεται κοράλλι φύκια μπορεί να διαδραματίσει σημαντικό ρόλο στην ενίσχυση της σταθερότητας ενός κοραλλιογενούς υφάλου. Τα κοράλλια φύκια εναποθέτουν προστατευτικό ασβέστιο στα τοιχώματα των κυττάρων τους και αυτά τα σκουριασμένα φύκια δρουν για να κονιώσουν διάφορα κοράλλια, ενισχύοντας τη δομή του υφάλου. Τα κοραλλιογενή σωματίδια έχουν μια δομή που μοιάζει με δέντρο που είναι κάπως ευέλικτη λόγω της παρουσίας ορισμένων ασβεστοποιημένων περιοχών. Τα κοράλλια Nongeniculate είναι αργές αναπτυσσόμενες κρούστες που μπορούν να κολλήσουν σε βράχους, κελύφη, άλλα φύκια και φύκια, εκτός από τα κοράλλια.
Πράσινα φύκια και κοραλλιογενείς υφάλους
Τα πράσινα φύκια περιλαμβάνουν μια άλλη ομάδα θαλάσσιων φυτών που έχουν προσαρμοστεί για να επιβιώσουν σε κοραλλιογενείς υφάλους. Στην πραγματικότητα, τα πράσινα φύκια κοραλλιών είναι τόσο επιτυχημένα σε ορισμένες περιοχές που πραγματικά γίνονται απειλή για τους οικοδεσπότες τους. Όταν η σχέση ανάμεσα σε κοραλλιογενή ύφαλο και πράσινα φύκια είναι ισορροπημένη, τα φύκια αναπτύσσονται στον ύφαλο και παρέχουν τροφή στα ψάρια που βόσκουν. Ωστόσο, όταν μια μεγάλη εισροή θρεπτικών συστατικών φτάνει με τη μορφή παράκτιων λυμάτων, η κοινότητα των φυκών γίνεται υπερφόρτιση, εκρήγνυται σε μέγεθος και κατά συνέπεια μειώνει την παρουσία βακτηριδίων που είναι ευεργετικά για τα κοράλλια, ενώ παράλληλα προωθεί την ανάπτυξη επιβλαβών βακτήρια.
Γλάστρες και κοραλλιογενείς υφάλους
Ως μέρος μιας σημαντικής οικολογικής τρισδιάστατης αλληλεπίδρασης με κοραλλιογενείς υφάλους και μαγγρόβια, οι γλάστρες τείνουν να ευδοκιμούν σε παράκτιους οικοτόπους. Τα νερά που προστατεύονται από τα κύματα του ωκεανού από τους κοραλλιογενείς υφάλους επιτρέπουν στις ρίζες των θαλασσινών και σε αντάλλαγμα οι αργοί προς τα κάτω και παγιδεύουν τα ιζήματα, εμποδίζοντας το φορτίο ιζημάτων στο νερό να γίνει πολύ υψηλό για τα κοράλλια επιζώ. Τα λιβάδια της θάλασσας μπορούν να περιέχουν πολλά διαφορετικά είδη και φτάνουν μόνο σε βάθη που επιτρέπουν οι απαιτήσεις της φωτοσύνθεσης.
Μαγγρόβια και κοραλλιογενείς υφάλους
Όπως οι γλάστρες, τα μαγκρόβια ανθίζουν ως αποτέλεσμα της προστασίας από τα βίαια κύματα των ωκεανών που προσφέρουν οι κοραλλιογενείς ύφαλοι. Τα μαγγρόβια ωφελούν τόσο τις γλάστρες όσο και τους κοραλλιογενείς υφάλους κυρίως με τον μετριασμό της διάβρωσης των ακτών και με τον τρόπο αυτό αποτρέποντας την είσοδο επιβλαβών ποσοτήτων ιζημάτων στα παράκτια ύδατα. Τα μαγκρόβια δάση λειτουργούν επίσης ως προστατευτική ζώνη για την απορροή της ρύπανσης, ιδιαίτερα των λυμάτων πλούσιων σε θρεπτικά συστατικά που μπορούν να διαταράξουν την οικολογική ισορροπία του δασικού συστήματος των κοραλλιογενών υφάλων - λιβαδιών λιβαδιών - μαγγροβίων. Οι θαλάσσιες ρίζες των μαγγροβίων λειτουργούν επίσης ως κρίσιμα φυτώρια για πολλά παράκτια είδη ψαριών.