Περίπου 20.000 διαφορετικά είδη μελισσών υπάρχουν παγκοσμίως, καταλαμβάνοντας κάθε βιότοπο που περιέχει ανθοφόρα φυτά. Οι μέλισσες ζουν σε μια συμβιωτική σχέση με τα λουλούδια, έχοντας αναπτύξει μια μακριά γλώσσα ή προβοσκίδα για να χτυπήσουν το νέκταρ. Πολλές μέλισσες είναι κοινωνικά έντομα, ζουν και εργάζονται μαζί σε πολύ οργανωμένες αποικίες ή κοινότητες. Ζουν σε διάφορα είδη φυσικών κατοικιών που ονομάζονται κυψέλες ή φωλιές.
Κοίλα δέντρα
Οι άγριες ή άγριες μέλισσες Apis mellifera είναι ευκοινωνικές, που σημαίνει ότι ζουν σε μεγάλες, καλά οργανωμένες αποικίες απασχολώντας έναν αυστηρό καταμερισμό εργασίας όσον αφορά την οικοδόμηση και τη συντήρηση κυψελών και τη φροντίδα απόγονος. Συνήθως χτίζουν τις κυψέλες τους σε κοίλα δέντρα, είναι κάτοικοι κοιλότητας, ένα χαρακτηριστικό που κάνει το είδος να εξημερωθεί εύκολα. Στην άγρια φύση, θα αναζητήσουν έναν κλειστό χώρο χωρητικότητας 15 έως 100 λίτρων για να χτίσουν την κυψέλη τους. Μόλις οι μέλισσες επιλέξουν ένα κατάλληλο δέντρο με κοίλο κορμό αρκετά ψηλά από το έδαφος για να αποτρέψουν κυνηγοί μελιού και με νότιο προσανατολισμό, προς τα κάτω είσοδο, ξεκίνησαν να προετοιμάζουν το νέο τους κυψέλη. Οι μέλισσες αφαιρούν τα εξωτερικά στρώματα του φλοιού για να εξομαλύνουν τα τοιχώματα, στη συνέχεια σφραγίζουν και τα επικαλύπτουν με πρόπολη ή "κόλλα μελισσών" φτιαγμένο από ρητίνες δέντρων και φυτών για την προετοιμασία κηρήθρας κεριού.
Υπόγεια κυψέλες
Οι μέλισσες, του γένους Bombus, προτιμούν να εντοπίζουν τις φυσικές κυψέλες τους υπόγεια, συνήθως σε εγκαταλελειμμένα λαγούμια και σήραγγες. Αφού αναδυθεί από την αδρανοποίηση την άνοιξη, η βασίλισσα μέλισσα θα επιλέξει μια περιοχή κυψέλης, καθώς οι μέλισσες χρησιμοποιούν φωλιά μόνο για ένα χρόνο. Θα ευθυγραμμίσει την τρύπα στο έδαφος με ξηρό γρασίδι και βρύα για την προετοιμασία του πρώτου γόνου των μελισσών. Οι εργαζόμενοι μερικές φορές θα χτίσουν ένα κερί πάνω από την είσοδο της κυψέλης για να αποτρέψουν τους αρπακτικούς τους, κυρίως μεφίτιδες.
Εναέρια κυψέλες
Οι εναέριες ή ανοιχτές κυψέλες κατασκευάζονται από μέλι της νοτιοανατολικής Ασίας που ανήκουν στα γένη Micrapis και Megapis. Αυτές οι μόνιμες φυσικές κυψέλες είναι παρόμοιες με τις προσωρινές φωλιές των μελισσών Apis mellifera. Οι ασιατικές μέλισσες κατασκευάζουν χτένες μελιού και brooder που συνδέονται με εκτεθειμένα άκρα δέντρων ή γκρεμούς. Καλύπτουν την άμεση γύρω περιοχή με κηρώδη πρόπολη για να την προετοιμάσουν για κατασκευή χτενών. Οι παράλληλες, ομοιόμορφα, σειρές χτενών καλύπτονται από τα σώματα των μελών της αποικίας μελισσών για προστασία από τα στοιχεία και τα αρπακτικά. Κατά τη διάρκεια των καταιγίδων οι μέλισσες στο εξωτερικό στρώμα επεκτείνουν τα φτερά τους πάνω από το σμήνος για να διατηρήσουν τις εσωτερικές χτένες στεγνές.