Πώς να υπολογίσετε το Kcat

Σχεδιάστε ένα διάγραμμα συγκέντρωσης προϊόντος σε σχέση με το χρόνο για τα δεδομένα από τον πρώτο δοκιμαστικό σωλήνα της ενζυματικής ανάλυσης. Σημείωση: ο οριζόντιος άξονας πρέπει να είναι "χρόνος" και ο κάθετος άξονας πρέπει να είναι "συγκέντρωση προϊόντος".

Υπολογίστε τη γραμμή γραμμικής παλινδρόμησης για τα σημεία δεδομένων που σχεδιάσατε στην Ενότητα 1, Βήμα 1. Ενώ οι υπολογιστές Excel και γραφήματα μπορούν εύκολα να προσδιορίσουν αυτό το γραμμικό μοντέλο, μπορείτε να αντλήσετε μια εκτίμηση της παλινδρόμησης κλίση της γραμμής διαιρώντας τη διαφορά στη συγκέντρωση προϊόντος μεταξύ παρακείμενων σημείων δεδομένων με τη διαφορά του χρόνου.

Καταγράψτε την κλίση της γραμμικής γραμμής παλινδρόμησης από την Ενότητα 1, Βήμα 2 ως "αρχική ταχύτητα αντίδρασης (Vo)." Σημείωση: στο μοντέλο γραμμής παλινδρόμησης "[συγκέντρωση προϊόντος] = m [χρόνος] + b," ο συντελεστής "m" είναι ο κλίση.

Επαναλάβετε τα βήματα 1, 2 και 3 για τους υπόλοιπους δοκιμαστικούς σωλήνες στον προσδιορισμό.

Σχεδιάστε το αντίστροφο της συγκέντρωσης υποστρώματος για κάθε δοκιμαστικό σωλήνα σε σχέση με το αντίστροφο της αρχικής ταχύτητας αντίδρασης (από την Ενότητα 1, Βήμα 4). Για παράδειγμα, εάν η αρχική ταχύτητα για δοκιμαστικό σωλήνα με αρχική συγκέντρωση υποστρώματος 50 μικρογραμμομόρια (uM) ήταν 80 uM / s, τα αντίστροφα θα ήταν 1/50 uM για τη συγκέντρωση υποστρώματος και 1/80 uM / s για την αρχική ταχύτητα. Σημείωση: η αντίστροφη συγκέντρωση υποστρώματος πρέπει να είναι στον οριζόντιο άξονα και η αντίστροφη αρχική ταχύτητα πρέπει να είναι στον κατακόρυφο άξονα.

instagram story viewer

Σημείωση: η συγκέντρωση υποστρώματος πρέπει να είναι στον οριζόντιο άξονα και η αρχική ταχύτητα αντίδρασης πρέπει να είναι στον κατακόρυφο άξονα.

Προσδιορίστε τη γραμμή γραμμικής παλινδρόμησης για το γράφημα που σχεδιάσατε στην Ενότητα 2, Βήμα 1. Σημείωση: επειδή θα πρέπει να γνωρίζετε το y-τέμνον για τη γραμμή παλινδρόμησης, πρέπει να εισαγάγετε τα σημεία από Ενότητα 2, Βήμα 1 σε Excel ή αριθμομηχανή γραφημάτων και χρησιμοποιήστε το ενσωματωμένο μοντέλο παλινδρόμησης λειτουργικότητα.

Διαιρέστε το 1 με το y-τέμνει από τη γραμμή γραμμικής παλινδρόμησης. Αυτό θα σας δώσει την τιμή του αντίστροφου του Vmax, τη μέγιστη ταχύτητα αντίδρασης για το ένζυμο. Σημείωση: εάν το μοντέλο γραμμικής παλινδρόμησης έχει τη μορφή "[Inverse Vo] = m [Αντίστροφο υπόστρωμα συμπ.] + B," τότε η τιμή του "b" θα είναι το y-τέμνον. Διαιρέστε το 1 με το "b" για να υπολογίσετε το αντίστροφο του Vmax.

Διαιρέστε το 1 με το αποτέλεσμα από την Ενότητα 2, Βήμα 3 για να υπολογίσετε την πραγματική τιμή του Vmax.

Προσδιορίστε τη συγκέντρωση του ενζύμου στην αρχική ανάλυση (δείτε τα ανεπεξέργαστα δεδομένα). Σημείωση: η συγκέντρωση του ενζύμου είναι η ίδια για όλους τους δοκιμαστικούς σωλήνες. Μόνο οι συγκεντρώσεις υποστρώματος ποικίλλουν στον προσδιορισμό.

Διαιρέστε το Vmax (από την Ενότητα 2, Βήμα 4) με τη συγκέντρωση ενζύμου (από την Ενότητα 2, Βήμα 5). Το αποτέλεσμα είναι η τιμή του Kcat.

Αντιγράφος με έδρα το Σικάγο, ο Andy Pasquesi έχει εκτεταμένη εμπειρία γραφής για αυτοκίνητα (BMW, MINI Cooper, Harley-Davidson), χρηματοοικονομικές υπηρεσίες (Ivy Funds, William Blair, T. Rowe Price, CME Group), πελάτες υγειονομικής περίθαλψης (Abbott) και καταναλωτικά αγαθά (Sony, Motorola, Knoll). Είναι κάτοχος Bachelor of Arts στα Αγγλικά από το Πανεπιστήμιο του Χάρβαρντ, αλλά δεν ενδιαφέρεται για το κόμμα της Οξφόρδης.

Teachs.ru
  • Μερίδιο
instagram viewer