Den yngre stenalder var for cirka 10.000 til 3.000 år siden. Det var begyndelsen på slutningen af stenalderen og begyndelsen på organiseret landbrug og bosættelse. Stenværktøj var normen, men begyndte at blive mere sofistikeret, specialiseret og blev ofte poleret til en fin finish. Sten med en høj procentdel af siliciumdioxid (SiO2) var bedst egnet til værktøj, da et skarpt slag får stykker til at "flage" af og efterlade skarpe kanter. Inden yngre stenalder benyttede mennesker sig af "håndakser", groft hugget hugge-, skrabnings- og skæreværktøj med et pæreformet, håndstensstensgreb, der tilspidsede sig til et skarpt punkt. På det tidspunkt, hvor yngre stenalder kom rundt, var håndakser faldet ud af favør, da de var sværere og mindre specialiserede end de nye værktøjer, som mennesker udviklede. Uanset hvad betragter forskere skabelsen af alle disse værktøjer som et tegn på tidlig menneskelig opfindsomhed.
Skrabere
Skrabere er et af de originale stenværktøjer, der findes overalt, hvor folk bosatte sig, længe før yngre stenalder begyndte. Skrabere blev brugt både til slagterdyr og derefter til at fjerne kød fra huderne. Hudene kunne derefter helbredes som læder. En skraber er et fladt stykke sten med en længere let buet kant. Kanten skærpes ved at "knække" eller banke flager af med en anden klippe.
Knive
Mens en skraber kan bruges til at skære ind i et dyr, kan en længere, tyndere klinge indsættes dybere ind i en slagtekroppe eller løbe langs en knogle og fungerer bedre for frugterne og grøntsagerne i et afviklet landbrug liv. Knive er sværere at fremstille end skrabere; når man knækker ned til et tyndt stykke sten, er det let at snappe stykket i to.
Pile og spydspidser
Pile og spydspidser er en mere sofistikeret form end enkle skrabere og knive. Spidsen er ikke kun mere delikat, men at forme enden af hovedet til at glide ind i skaftet og også give fremspring, der kunne bruges til at binde punktet på plads, krævede en ny grad af præcision og omsorg.
Akser
Den polerede stenøkse betragtes som en af de vigtigste udviklinger i yngre stenalder. Når øksen var formet gennem afskalning, blev en anden sten brugt til at male den glat. Akser gør rydning af jord meget enklere og tillader spredning af landbruget. Akser fremstiller også effektive våben, og det menes, at mange neolitiske økser var beregnet til at blive brugt på fjender snarere end træer. Behovet for selvbeskyttelse førte til et mere centraliseret landsbyliv inden for høje mure.
Adzes
Adze er et træbearbejdningsværktøj. Det er et fladt blad fastgjort til et håndtag, lidt som en økse, bortset fra at bladet drejes vandret, lidt som en hakke. Når det rammer et stykke træ, trækker det en chip ud. Det blev og bruges stadig i kulturer, der fremstiller dugout-kanoer, da det er en af de hurtigste måder at udhule en træstamme på. En større adze er også et effektivt værktøj til at grave, fjerne rødder og generelt forberede jord til plantning.
Hamre og mejsler
Mejsler blev lavet ved at fastgøre et skarpt stykke sten til enden af en robust pind. Hamre blev lavet ved at afrunde en klippe og enten bore et hul igennem den eller skabe et hak rundt om ydersiden, der kunne bruges, når man fastgør hovedet til et håndtag ved reb eller sene. Hamre blev for det meste brugt med mejsler i træbearbejdning, selvom forskellen mellem en hammer og en krigsklub virkelig kun er i brugen.