Mikrobiologi er studiet af mikroorganismer: mikroskopiske eller knap synlige encellede livsformer såsom bakterier, arkæer, protozoer og nogle svampe, og endda nogle ekstremt små flercellede planter, dyr og svampe. Mikrobiologer studerer også livagtige ikke-organiske fænomener som vira, prioner, viroider og virioner. "Mikrobe" er en betegnelse for alle disse enheder. Optælling i mikrobiologi er bestemmelsen af antallet af individuelle levedygtige mikrober i en prøve; fire grundlæggende teknikker er mulige.
Tæller kulturer
En direkte foranstaltning til mikrobiel optælling er standardpladeantalet, også kaldet et levedygtigt antal. For denne optælling dyrker du en prøve ved at fortynde den, placere den på plader med dyrkningsmedium og inkubere dem i et bestemt tidsrum. Du tæller derefter antallet af kolonier og bruger dette nummer til at udlede det oprindelige antal mikrober i prøven. Teknisk set giver en pladetælling ikke antallet af individuelle mikrober, men snarere "kolonidannende enheder, "fordi du ikke kan vide med sikkerhed, om hver koloni faktisk kom fra en enkelt mikrobe eller fra en lille gruppe mikrober. Imidlertid betragtes disse optællinger som meget nøjagtige til estimering af antallet af mikrober i originale prøver. Ulemper er, at denne test er tidskrævende og kræver tidskrævende udstyr, der skal forberedes korrekt.
Individuelle tællinger
Direkte mikroskopiske optællinger, også kaldet samlede celletællinger, er en anden form for direkte optælling. Først opdeler du en prøve i et antal lige store kamre. Derefter bestemmer du det gennemsnitlige antal mikrober pr. Kammer ved at tælle nogle eller alle under et mikroskop. Endelig bruger du dette gennemsnit til at beregne antallet i den originale enhed. Den største ulempe ved direkte mikroskopiske optællinger er, at det er svært at skelne levende mikrober fra døde, så denne metode giver muligvis ikke en nøjagtig levedygtig optælling.
Lysstråler, skyer af mikrober
Uklarhedstest er former for indirekte optælling. Uklarhed er en væskes uklarhed. I turbidimetrisk måling lægger du en prøve i opløsning, måler den nye opløsnings uklarhed ved at skinne lys igennem den med et spektrofotometer, estimer derefter antallet af levende mikrober, det ville tage for at producere det observerede uklarhedsniveau. Ulempen her er, at nogen allerede skal have foretaget adskillige standardpladetællinger af den pågældende mikrobe i for at fremstille prøveløsninger med varierende uklarhed, så du har en standard til at måle din nuværende prøve mod. Du skal også passe på at koncentrere din prøve for meget, fordi et turbidimetrisk antal kun er nøjagtigt, hvis ingen mikrober i prøven blokerer for andre. I en visuel turbiditetssammenligning sammenligner du turbiditeten af din prøve med turbiditeten for en enhed af samme størrelse og det kendte mikrobielle antal og estimerer en optælling baseret på denne sammenligning.
Indirekte resultater
To andre former for indirekte optælling er massebestemmelse og måling af mikrobiel aktivitet. For en massebestemmelse optælling, vejer du mængden af biologisk stof i din prøve, sammenlign dette vægt til en standardkurve for kendte mikrobielle optællinger og estimer det oprindelige mikrobielle antal ud fra dette sammenligning. Til en måling af mikrobiel aktivitet måler du mængden af et biologisk produkt i din prøve, f.eks metabolisk affald, sammenlign derefter dette med en standardkurve for kendte optællinger og estimer din optælling ud fra dette sammenligning.