Taxonomer klassificerer alt liv på jorden i et af fem kongeriger. Medlemmer af de første fire kongeriger, Animalia, Plantae, Fungi og Protista, er alle eukaryote organismer. Dette betyder, at organismernes celler, som kan være encellede eller flercellede, alle har deres genetiske materiale indeholdt i en kerne. Det femte rige, Monera, indeholder alle encellede organismer, der ikke har en ægte kerne. Medlemmer af riget Monera kaldes almindeligvis bakterier.
Eubacteriophyta
Eubacteriophyta er de ægte grampositive bakterier. Grampositiv betyder, at disse bakterier vil give et positivt resultat i en Grams plet. Grampositive bakterier har et højere peptidoglycanindhold end gramnegative bakterier, mens gramnegative bakterier har en højere lipidkoncentration. Inden for denne stamme kan bakterier være sfæriske (coccus), stavformede (bacillus) eller proptrækkerformede (spirillum).
Cyanophyta
Denne bakteriefylum indeholder organismer, der engang var kendt som "blågrønne alger." I dag klassificeres de generelt som cyanobakterier, da fraværet af en kerne tydeligt indikerer, at de er tættere beslægtede med de andre bakterier, end de er til alger. Men ligesom alger indeholder cyanobakterier klorofyl og er i stand til at fotosyntese. Nogle forskere spekulerer i, at cyanobakterierne er forløberne for kloroplaster i højere fotosyntetiserende organismer, såsom alger og planter.
Proteobakterier
Proteobacteria er den mest forskelligartede fylde inden for Monera-kongeriget, og indeholder kvælstoffikserende bakterier, der gør kvælstof fra luften tilgængeligt for planter og dyr. Uden dem kunne livet som vi kender det ikke eksistere. Proteobakterier inkluderer også det velkendte E. coli og salmonella arter af bakterier, velkendte for at være potentielle stoffer til madforgiftning.
Spirochaetes
Disse bakterier har en oprullet form, som deres navn antyder. Treponema pallidum, en bakterie i denne fylum, forårsager syfilis hos mennesker. Borrelia burgdorferi, et andet medlem af denne gruppe, forårsager Lyme-sygdommen. Ikke alle spirochaeter er skadelige for deres værter. Nogle af dem lever i fordøjelsesspor fra termitter, hvor de sammen med andre mikroorganismer bidrager til termitens evne til at fordøje cellulose. Dette er gavnligt, i det mindste for termitten.
Klassifikation
Det er værd at bemærke, at der er forskellige tankeskoler vedrørende klassificering af organismer. Der er ingen "officiel" taksonomi af Monera i specifik phyla. Faktisk abonnerer mange forskere på et system, der udelukker kongeriget Monera og andre fire kongeriger også og erstatter dette med et system, hvor alt liv er opdelt i tre domæner. To af disse ville indeholde organismer, der tidligere var medlemmer af Monera, mens alt andet liv ville være en del af det tredje domæne.