Kloning er et varmt etisk spørgsmål i det videnskabelige samfund, men bakterier kloner sig selv hele tiden. I en proces kaldet binær fission fordobler en bakterie dens størrelse og genetiske materiale og opdeles derefter for at producere to identiske celler.
Sammenlignet med eukaryot celledeling eller mitose er binær fission en relativt enkel proces. For det første kopierer bakterien sit DNA - genetiske materiale, som i bakterier er cirkulært. DNA giver alle de oplysninger, der er nødvendige for at skabe en identisk celle. DNA'et adskilles derefter i modsatte ender af cellen, og proteiner, der er nødvendige for celledeling, samles i midten af cellen. Bakterien fordobler normalt også sin intracellulære væske, også kaldet cytoplasma. Proteinerne spalter cellen i to, og i de fleste bakterier er der bygget en ny cellevæg til at fuldføre opdelingen.
Fordelen ved binær fission fra bakteriers perspektiv er, at den er hurtig og enkel. Fra perspektivet af sygdomsbekæmpelse og forebyggelse er binær fission fordelagtig, fordi det forenkler produktionen af medicin. Typisk er der kun brug for et lægemiddel til behandling af en bakteriel infektion, fordi alle bakterierne er identiske og vil reagere på samme måde. Desværre udvikler dog nogle bakterier lægemiddelresistens gennem mutation, hvilket gør infektioner meget sværere at behandle.