Honduras er den næststørste nation i Mellemamerika, der strækker sig over øen fra Caribien til Stillehavet. På trods af aggressiv skovrydning opretholder Honduras stadig mere skovklædt område end de fleste andre lande i regionen. Flere typer skove dominerer landskabet, herunder skyskov, fyrreskov, regnskov og mangrover. Plante- og dyrearter findes i overflod i de forskellige skovøkosystemer i Honduras, herunder arter, der er forsvundet fra resten af regionen. Mere end en naturreservat i Honduras er blevet afsat for at beskytte mangfoldigheden i livet i området.
Pattedyr i Honduras
Mere end 200 arter af pattedyr findes i Honduras skove. Flere sjældne væsner er inkluderet blandt Honduras-dyrene. Flagermus (Chiroptera) tegner sig for næsten halvdelen af pattedyrene i landet med 98 kendte arter, der besætter hvert skovøkosystem. Den ikoniske jaguar (Panthera onca) er en af de sjældneste arter i hele Mellemamerika. Jaguarer er oftest set i mangroveområder og er en truet art i Honduras. Vestindiske manater (Trichechus manatus), der engang var almindelige langs den caribiske kyst i Honduras, ses nu sjældent undtagen i fjerntliggende mangroveområder. Honduras 'nationale dyr, den hvide tailed hjorte (Odocoileus virginianus), er den største hjorte art i landet. Oftest set i lavlandet og fyrreskove er den hvide-tailed hjorte en beskyttet art. En bred vifte af aber findes også i Honduras, herunder den hvidhovedede capuchin (Cebus capucinus), Mexicansk spider abe (Ateles geoffroyi vellerosus) og gylden kappe aber (Alouatta palliata palliata).
Et overflod af fugle
Honduras har en usædvanlig rig mangfoldighed af fuglearter. Der er 18 papegøjearter, herunder den appelsinkinnede parakit (Brotogeris jugularis), den store grønne ara (Ara ambigua), Stillehavets parakit (Aratinga strenua) og den skarlagenrøde ara (Ara macao), som er Honduras 'nationale fugl. Fundet i tropiske skove i høj højde, er den sort-udjævnede svale (Notiochelidon pileata) en trækfugl, der er almindelig i Honduras. Den kastanjemandiblede tukan (Ramphastos swainsonii) er et hyppigt syn i Honduras kystnære lavlandsskove. Kendt for deres farvestrålende ansigt og overdrevne næb holdes de undertiden som kæledyr på trods af at de er en beskyttet art.
Tropiske træer
Hvert skovøkosystem har en keystone-art, hvilket betyder, at en art definerer skovtypen. I Honduras angiver sort mangrovetræ (Avicennia germinans) og rød mangrovetræ (Rhizopora-mangel) grænserne for mangroveøkosystemet. Mahogni (Swietenia macrophylla) træer blandes undertiden med mangrovesorter på tørt land, hvilket indikerer begyndelsen på de kystnære lavlands fyrreskove. Honduras fyr (Pinus caribaea var. hondurensis) og ocote fyr (Pinus oocarpa) er de eneste to arter af fyr i landet, selvom de dominerer enorme områder med lavlandsskov. Et af de mest imponerende træer i Honduras er ceiba (Ceiba pentandra). Nogle gange kaldet kapok, det er et massivt træ, der kan nå 250 fod i højden med en 10 fods diameter stamme.
Blomstrende planter
Honduras vegetation er meget rig. Forskere vurderer, at der er mere end 5.000 arter af planter i Honduras. Blomstrende planter findes i overflod i de fleste områder af landet, hvor de giver mad til insekt- og fuglearter. En af de mest produktive plantearter i Honduras er salvie (Salvia). Fersken salvie (Salvia dorisiana), Karwinskis salvie (S. karwinskii) og blå salvie (Salvia cacaliifolia) er alle buskede, flerårige arter, der blomstrer i de kølige, montane skove i det centrale Honduras. En gang en fødekilde for oprindelige mennesker er gul lotus (Nelumbo lutea) en af de få blomstrende planter, der findes i mangroveskovene. Kendt for sine gule skålformede blomster dyrkes den ofte i vandhaver som en prydplante.