Co je výčet v mikrobiologii?

Mikrobiologie je studium mikroorganismů: mikroskopických nebo stěží viditelných jednobuněčných forem života, jako jsou bakterie, archea, prvoky a některé houby a dokonce i některé extrémně malé mnohobuněčné rostliny, zvířata a houby. Mikrobiologové také studují realistické neorganické jevy, jako jsou viry, priony, viroidy a viriony. „Mikrob“ je termín pro všechny tyto entity. Enumerace v mikrobiologii je stanovení počtu jednotlivých životaschopných mikrobů ve vzorku; jsou možné čtyři základní techniky.

Jedním přímým měřítkem pro mikrobiální výčet je standardní počet destiček, který se také nazývá životaschopný počet. Pro tento počet kultivujete vzorek zředěním, umístěním na plotny kultivačního média a inkubací po stanovenou dobu. Poté spočítáte počet kolonií a pomocí tohoto počtu odvodíte původní počet mikrobů ve vzorku. Technicky vzato, počet destiček nedává počet jednotlivých mikrobů, ale spíše „tvorbu kolonií“ jednotek, „protože nemůžete s jistotou vědět, zda každá kolonie skutečně pocházela od jednoho mikroba nebo od malé skupiny mikroby. Tyto počty se však považují za velmi přesné pro odhad počtu mikrobů v původních vzorcích. Nevýhodou je, že tento test je časově a prostorově náročný a vyžaduje speciální vybavení, které musí být správně připraveno.

Přímé mikroskopické počty, nazývané také celkový počet buněk, jsou další formou přímého výčtu. Nejprve rozdělte vzorek do několika stejně velkých komor. Poté určíte průměrný počet mikrobů na komoru spočítáním některých nebo všech pod mikroskopem. Nakonec použijete tento průměr k výpočtu počtu v původní jednotce. Hlavní nevýhodou pro přímé mikroskopické počty je, že je obtížné odlišit živé mikroby od mrtvých, takže tato metoda nemusí poskytnout přesný životaschopný výčet.

Testy zákalu jsou formy nepřímého výčtu. Zákal je zakalení kapaliny. Při turbidimetrickém měření vložíte vzorek do roztoku, změříte oblačnost nového řešení zářením světla pomocí spektrofotometru pak odhadněte počet živých mikrobů, které by byly zapotřebí k produkci pozorované úrovně zákalu. Nevýhodou je, že někdo již musel provést řadu standardních počtů destiček daného mikroba aby bylo možné připravit roztoky vzorků s různým zákalem, abyste měli standard pro měření svého aktuálního vzorku proti. Musíte si také dát pozor na přílišné soustředění svého vzorku, protože turbidimetrický počet je přesný, pouze pokud žádné mikroby ve vzorku neblokují žádné další. Ve vizuálním porovnání zákalu porovnáte zákal vašeho vzorku s zákalem jednotky stejné velikosti a známého mikrobiálního počtu a na základě tohoto srovnání odhadnete výčet.

Dvě další formy nepřímého výčtu jsou hromadné stanovení a měření mikrobiální aktivity. Při výčtu stanovení hmotnosti zvážíte množství biologické hmoty ve vzorku, porovnejte to váhu na standardní křivku pro známé počty mikrobů a odhadnout z toho původní mikrobiální číslo srovnání. Pro měření mikrobiální aktivity měříte množství biologického produktu ve vašem vzorku, například metabolický odpad, porovnejte to se standardní křivkou pro známé počty a odhadněte z toho svůj výčet srovnání.