Archebakterie jsou organismy, které se ve skutečnosti biochemicky a geneticky velmi liší od ostatních bakterií. Proto jsou archeobakterie zastaralým výrazem a nyní jsou klasifikovány v doméně Archaea. Klasifikace v této doméně jsou neoficiální kvůli debatám o potomcích mikrobů. Mnozí žijí v extrémních teplotách hydrotermálních průduchů hluboko v oceánu nebo v horkých pramenech a někteří žijí v bahně bez kyslíku. Jiní žijí ve velmi slané vodě a další v extrémně alkalickém nebo kyselém prostředí nebo dokonce v oleji. Následující příklady jsou klasifikovány podle taxonomického řádu království, kmene, třídy, řádu, rodiny, rodu a druhu.
Hydrotermální Vent Archaea
Jedním z příkladů v doméně Archaea je Methanocaldococcus jannaschii, v současné době klasifikovaný jako Archaea: Euryarchaeota: Methanobacteria; Methanobacteriales: Methanobacteriaceae, Methanocaldococcus a druhy jannaschii. Bylo získáno z hydrotermálního průduchu na dně oceánu žijícího při tlacích více než 200 atmosfér a teplotách nad 85 stupňů Celsia. Přežívá bez kyslíku a produkuje metan jako produkt svého metabolismu.
Archaea prosperující v lidském střevě
Methanibrevibacter smithii v současné době klasifikován jako Archaea; Euryarchaeota; Methanobakterie; Methanobacteriales; Methanobacteriaceae; Methanobrevibacter a druh smithii. Zabírá lidské střevo a funguje bez kyslíku. Převádí CO2 na metan a je důležitý při rozkladu živin.
Sůl milující Archaea
Haloquadra walsbyi je v současné době klasifikován jako Archaea; Euryarchaeota; Halobakterie; Halobacteriales; Halobacteriaceae; Haloquadratum; a druhy walsbyi. Sídlí v extrémně slaném prostředí a ve fotosyntetickém procesu využívá energii ze slunce. Jsou čtvercového tvaru a mají plynem naplněné vaky, které jim umožňují plavat. Mohou se také spojit a vytvořit velké listy.
Hlubinná archaea, která používá síru
Thermococcus litoralis je další hlubinný druh s tepelným odvětráváním. V současné době je klasifikován jako Archaea; Euryarchaeota; Termokoky; Thermococcacae; Thermococcus; a druh litoralis. K růstu vyžaduje síru a na rozdíl od ostatních příkladů neprodukuje metan. Prosperuje při vysokých teplotách a je jednou z archaeí, včetně dosud neobjevených druhů.
Malá, parazitická archaea stojí sama v klasifikaci
Nanoarchaeum equitans je jediným známým členem podtřídy Nanoarchaeota v Archaei. Vědci zjistili, že žije na buněčných stěnách nového Ignicoccus druhy vyskytující se na dně oceánu, poblíž termálních otvorů a v horkém prameni v národním parku Yellowstone. Nanoarchaeum equitans, který, jak se zdá, má parazitní vztah s Ignicoccus je malý, má průměr jen 400 nanometrů a zdá se, že se mu daří při teplotách mezi 167 a 204 stupni Fahrenheita.