Dusík je prvek obsažený ve všech bílkovinách a je nezbytný pro život rostlin a zvířat. Plynný dusík ve vzduchu musí být před použitím rostlinami fixován na sloučeniny, a to buď bleskem, nebo bakteriemi žijícími v půdě. Mezi tyto sloučeniny patří amoniak a dusičnany. Zvířata pak mohou přijímat dusík konzumací rostlin. Když živá hmota zemře nebo se vylučuje odpad obsahující dusík, bakterie a houby přeměňují organický dusík zpět na amoniak.
Bakterie Nitrobacter
Druhy bakterií v půdě, které přeměňují dusitany na dusičnany, patří do rodu Nitrobacter. Existují čtyři identifikované druhy: Nitrobacter winogradskyi, Nitrobacter hamburgensis, Nitrobacter agilis a Nitrobacter alkalicus. V roce 2007 fylogenetická studie rodu Nitrobacter, publikovaná v „Systematické a aplikované mikrobiologii“, identifikovala u některých druhů 30 různých kmenů. Nitrobacter existuje v půdě a sladké vodě, kde je pH mírné. Neroste na vysoce kyselých stanovištích.
Bakterie Nitrosomonas
Bakteriální druhy Nitrobacter se obvykle vyskytují spolu s bakteriemi z rodu Nitrosomonas ve smíšených bakteriálních společenstvích nazývaných konsorcia. Tyto dva druhy bakterií jsou vzájemně závislé, protože Nitrosomonas produkuje dusitany, které Nitrobacter potřebuje, a Nitrobacter čistí dusitany, které mohou potlačit Nitrosomonas, pokud je jim dovoleno stavět nahoru.
Mořské bakterie
V oceánu existují dva další typy bakterií, které oxidují dusitany na dusičnany. Jedná se o Nitrococcus mobilis a Nitrospina gracilis. Nitrococcus mobilis, izolovaný z vod jižního Pacifiku, je velký pohyblivý kokus s jedinečnými tubulárními buněčnými membránami. Nitrospina gracilis je dlouhá, štíhlá a tyčinkovitá, bez rozsáhlého systému buněčných membrán. Nitrospina se stala komerčně dostupnou pro lidi, kteří udržují mořská akvária, aby pomohla udržet hladinu dusičnanů ve vodě v nádrži. Bakterie pomáhají oxidovat toxické dusitany, které ryby produkují.