Fylogenetický strom je grafické znázornění evolučních vztahů, které ukazuje, jak se mohly organismy odchýlit od společného předka. Dříve to bylo provedeno porovnáním anatomie a fyziologie živých organismů a fosilií, ale nyní se běžně používá genetická informace získaná z nukleotidových sekvencí DNA. Organismy s několika podobnostmi lze nalézt na samostatných „větvích“ fylogenetického stromu a organismy se specifickými podobnostmi by se nacházely na „větvičkách“ stejné větve. Fylogenetický strom je metoda pro pochopení druhů a evolučních změn v organismech.
Vyberte modelový organismus pro srovnání vztahů. To lze provést pomocí druhu, plemene nebo nukleotidové sekvence, která představuje organismus. Příkladem organismu může být kráva. Zbytek stromu by na základě genetických vlastností demonstroval, jak úzce souvisí kráva s jinými organismy.
Vyberte outgroup. Outgroup je méně blízký organismus nebo výrazně odlišná nukleotidová sekvence. Pokud je modelovým organismem kráva, pak by možná outgroup byla ryba. Čím více budou dva organismy, tím dále na fylogenetickém stromu bude jejich rozbíhající se větev. Čas je reprezentován nejstarším datem v dolní části grafu a současností v horní části grafu. Umístění větví ukazuje přibližně to, kdy v minulosti evoluční rys možná změnil rodový organismus na různé druhy.
Určete sadu charakteristik, které se mají použít pro srovnání. Mezi příklady patří „má čtyři nohy“, „přežvýká“, „živě porodí“ nebo „doroste.“ Nukleotidové sekvence jsou spravedlivé abecední reprezentace DNA, která určuje vlastnosti, takže další možností by bylo: „obsahuje sekvenci ATGGACACGGA. "
Rozdělte organismy na základě charakteristik. Když jeden organismus neobsahuje požadovaný znak, vytvoří se větev ve fylogenetickém stromu. Charakteristické „má čtyři nohy“, krávy, ovce a jeleni by byli všichni na jedné větvi, zatímco ryby by byly na oddělené větvi. Vložte obrázek nebo sekvenci krávy do horního rohu plakátové desky a ryby do protějšího rohu a nakreslete z nich dvě čáry do spodní části papíru ve tvaru protínajícího se V.
Pokračujte v oddělování modelových organismů nebo nukleotidových sekvencí, dokud nebude mít každý příklad jedinou větev z větve na větvičku. Charakteristika „má vlnu“ by oddělovala ovce od jelenů a krav na singulární větev. Umístěte obrázek ovce poblíž obrázku ryby a nakreslete čáru, která se spojuje ve tvaru písmene V až k větvi krávy. Použití charakteristiky „má načechraný ocas“ by ohraničilo krávu od jelena. Vložte obrázek jelena mezi krávu a ovce a nakreslete další čáru do tvaru V, která se protíná nad rybími a ovčími čarami. Když má každý druh jedinou větev, byl fylogenetický strom dokončen.