Mikroorganismy nalezené v odpadních vodách pocházejí ze dvou zdrojů - půdy a sanitárního odpadu. Jeden mililiter splaškové vody obvykle obsahuje mezi 100 000 a 1 milionem mikroorganismů, uvádí web Mountain Empire Community College. Zatímco většina z těchto organismů, jako jsou různé druhy bakterií, hrají klíčovou roli při rozkladu odpadu a jsou považovány za nedílnou součást organické hmoty, některé jsou patogenní nebo přenášející choroby a představují hrozbu pro veřejnost vřesoviště.
Parazitické bakterie
Bakterie jsou jednobuněčné organismy, které se množí v suspendované látce, jako je kal. Když narazí na přísun živin, krmí se přijímáním potravy přímo přes buněčnou stěnu a rychle se množí. Mezi mnoha druhy bakterií v odpadních vodách jsou nejběžnějšími typy fekální koliformní bakterie, které pocházejí z lidských střev a šíří se lidskými výtoky. Tyto parazitické bakterie vyžadují živý organismus nebo hostitele a snadno dostupné zásoby potravy.
Patogenní bakterie
Specifické formy parazitických bakterií produkují toxiny, které způsobují onemocnění hostitelského organismu. Tyto patogenní typy bakterií mohou vylučovat lidé, kteří trpí úplavicí, cholerou, břišním tyfem a jinými onemocněními střev. Patogeny typicky se vyskytující v odpadních vodách zahrnují Salmonella, Shigella, E. coli, Streptococcus, Pseudomonas aeroginosa, mycobacterium a Giardia Lamblia, podle webových stránek Rady pro kvalitu a zdraví vody. Ohniska shigelózy jsou výsledkem sladkovodních měkkýšů kontaminovaných toky odpadních vod, jak zaznamenávají Centra pro kontrolu a prevenci nemocí v USA. Vzhledem k populačnímu růstu a zvýšenému vypouštění do odpadních vod převládá výsledný počet patogenních bakterií nad přirozenými procesy rozkladu a ředění.
Saprofytické bakterie
Saprofytické bakterie pohlcují mrtvé organické látky, což pomáhá rozkládat odpad na anorganické a organické vedlejší produkty. Tyto bakterie hrají rozhodující roli při čištění odpadních vod tím, že usnadňují nebo urychlují proces rozkladu organických látek. Bez saprofytických bakterií nemusí dojít k rozkladu. Různé druhy saprofytických bakterií zahynou poté, co sehrály svoji roli v příslušném stadiu rozkladu.
Viry
Mezi mikroby nacházejícími se v odpadních vodách patří viry, což jsou parazitické organismy, jejichž živení, živení a reprodukce vyžadují živou hmotu. Patogenní viry, které existují v odpadních vodách, zahrnují obrnu a hepatitidu. V odpadních vodách se také nacházejí různé střevní viry, jako je coxsackie, adenovirus a ECHO, nebo enterální cytopatický lidský sirotek. Další běžný typ viru v odpadních vodách, který se živí bakteriemi, ale ne lidmi, je známý jako fág nebo bakteriofág. Na rozdíl od bakterií je počet patogenních virů v odpadních vodách malý. Podle webové stránky Mountain Empire Community College může mezi odhadovaným milionem koliformních bakterií existovat jediný infekční virus.