Řeka Mississippi je domovem různých vodních rostlin a živočichů v komplexním vzájemně propojeném ekosystému. Vodní rostliny poskytují potravu a útočiště mnoha různým druhům v řece a mohou být tak malé jako jednobuněčné řasy. Řeka Mississippi zahrnuje řadu zvířat, od bezobratlých, po ryby, žáby a další.
Řasy
Podle ministerstva přírodních zdrojů v Iowě je Mississippi hostitelem dvou hlavních druhů řas: zelené a modrozelené. Zelené řasy jsou základní biologickou složkou každého zdravého ekosystému; vytvářejí velké kolonie, které mohou dát vodě nazelenalý nádech. Modrozelené řasy jsou méně žádoucí a jsou považovány za obtěžující řasy. Jsou spojeny se stresovanými ekosystémy a mohou způsobit nepříjemné chutě ryb nebo zabít celou populaci.
Okřehek
Tato běžná volně plovoucí rostlina má jediný malý list a kořeny, které visí ve vodě, aby nasávaly živiny. Jak naznačuje jeho název, okřehek je důležitým zdrojem potravy pro mnoho vodních ptáků.
Lekníny
Bílé lekníny jsou běžným místem v řece Mississippi a jsou složeny z velkých plovoucích listů s kožovitou strukturou. Produkují velké bílé květy na vrcholu listů a jsou zakořeněny v bahně dole.
Rak
Tito korýši, také nazývaní langusty nebo crawdadové, připomínají malé humry. Jsou to především krmítka pro dno a konzumují zbytky jiných zvířat, zdechlin a malých zvířat. V řece Mississippi žijí původní i invazní raci.
Sumec
Kanál sumci jsou běžným jevem v řece Mississippi. Jsou nejpočetnějším druhem sumců. Tyto ryby mohou dorůst do překvapivých velikostí a držet se hlavně dna řeky. Jsou pozoruhodní svou tendencí udeřit na mnoho různých druhů návnad, ale měli by se jíst jen zřídka kvůli nebezpečí kontaminace PCB (polychlorovaným bifenylem).
Leopard Frog
Tyto skvrnité žáby se také nazývají luční žáby. Žijí v okolí řeky Mississippi. Často slouží jako druh indikátoru životního prostředí kvůli jejich náchylnosti ke znečišťujícím látkám a znečišťujícím látkám. Tráví většinu času podél okrajů potoků a jiných vodních ploch a jedí většinou hmyz, členovce a jiné bezobratlé.