Ekosystémy deštného pralesa poskytují domov některým z nejhustších a nejrůznějších zvířecích komunit na Zemi. Deštné pralesy jsou však neustále využívány pro své bohaté zdroje. Lidské praktiky, jako je těžba a odlesňování, mají na tato stanoviště vážné dopady, což způsobí, že nespočet druhů živočichů přijde o domov alarmující rychlostí.
Ptactvo
Několik druhů tukanů, papoušků a jiných tropických ptáků jihovýchodních a středoamerických deštných pralesů hrozí vyhynutím kvůli těžbě dřeva a dalším příčinám odlesňování. Orel harpyjský, jeden z největších známých druhů orlů na světě, prospívá v nížinách tropických deštných pralesů od jižního Mexika po východní Bolívii; stanoviště tohoto ptáka se neustále zmenšuje v důsledku jednoznačných postupů odlesňování a ničení hnízdišť z průmyslových postupů, jako je těžba a těžba ropy. Ztráta stanoviště také ohrožuje tisíce druhů stěhovavých ptáků. Tyto druhy cestují na sever během severoamerického léta a zpět do tropů v zimě; stále více a více se každý rok vrací a nenajde žádný domov ani zničená hnízdiště.
Savci
V deštném pralese ztrácí své domovy široká škála druhů savců, od nejmenšího hlodavce po největšího predátora. Mnoho větších savců potřebuje dostatek prostoru pro shánění potravy nebo lov. Jak průmyslové postupy v určitých oblastech postupují, musí se savci deštných pralesů, jako jsou gorily, jaguáři a pumy, omezit na roztříštěná stanoviště s nedostatečnými zdroji. Odlesňování nejpříměji postihuje stromové savce (ty, kteří žijí na stromech), jako je létající veverka a kaloň, stejně jako několik druhů opic. Celé komunity zůstávají bez domova a nutí je přizpůsobit se prostředí bez stromů, na které nejsou připravené.
Plazi a obojživelníci
Odlesňování je hlavní příčinou ztráty přirozeného prostředí pro většinu plazů deštného pralesa, zatímco mnoho druhů obojživelníků také přichází o domov kvůli ropné vrty a těžební praktiky, které kontaminují rybníky, řeky a potoky, a nutí je hledat nové zdroje vody pro svůj semiaquatický životní styl. Mezi ohrožené a ohrožené druhy plazů a obojživelníků patří ropucha zlatá, gekon madagaskarský a leguáni, stejně jako několik druhů žab jedovatých, zejména kolumbijských.