Malajsie, známá svou biodiverzitou, je domovem 15 000 kvetoucích rostlin. Flóra a fauna národa jsou však vážně ohroženy a došlo k 70% vyčerpání původního růstu. Podle Červeného seznamu Mezinárodní unie pro ochranu přírody (IUCN) má Malajsie od roku 2007 686 ohrožených druhů rostlin. Malajské zákony chrání ptáky, savce a hmyz. Flóra a fauna jsou chráněny, pouze pokud rostou v národním parku nebo rezervaci.
Mezi hlavní lesní typy v Malajsii patří Giam Kanching nebo vzácný dipterokarpový les, mangrovový les, rašeliniště a bažinatý les, uvádí Worldwide Wildlife Fund. Strom dipterocarp, známý svým plodem s dvoukřídlými semeny, roste na zemi, která je těsně nad mořem do nadmořské výšky přibližně 900 metrů. Nížinné dipterokarpové lesy, které se nacházejí až 300 metrů nad mořem, byly zdecimovány kvůli zemědělství a dalším činnostem náročným na půdu. Zatímco v lesní rezervaci Kanching je chráněna kapra dipterokarpů, je tento druh na Červeném seznamu považován za kriticky ohrožený - na pokraji vyhynutí.
Tato masožravá tropická rostlina roste pouze v mechových lesích ve výšce 2 000 až 2 600 metrů na hoře Trus Madi na Borneu. Nepenthes macrophylla má džbánkovité listy, které visí z deseti metrů dlouhých vinic. Hmyz klouzá z voskovitého vrcholu květu do kaluži kyseliny vylučované žlázami ve spodní části květu, podle ASEAN Review of Biodiversity & Environmental Conservation. Červený seznam IUCN kategorizoval Nepenthes macrophylla jako kriticky ohrožený.
Taxitheliella richardsii, považovaná za kriticky ohroženou na Červeném seznamu, je mech z čeledi Sematophyllaceae a pochází z Malajsie. Jedinou známou oblastí (méně než 10 km²), kde byl mech nalezen, je Sarawak, malajský stát na severozápadě Bornea. Taxitheliella richardsii roste na dřevinách a shnilých kládách v subtropických lesích, což je stanoviště, které mizí kvůli těžbě dřeva a těžbě dřeva.
