Sestrojte graf koncentrace produktu v závislosti na čase pro data z první zkumavky pro enzymatický test. Poznámka: vodorovná osa by měla být „čas“ a svislá osa by měla být „koncentrace produktu“.
Vypočítejte linii lineární regrese pro datové body, které jste vykreslili v části 1, krok 1. Zatímco Excel a grafické kalkulačky mohou tento lineární model snadno určit, můžete odvodit odhad regrese sklon čáry dělením rozdílu v koncentraci produktu mezi sousedními datovými body jejich rozdílem v čase.
Zaznamenejte sklon lineární regresní přímky z části 1, krok 2 jako „počáteční reakční rychlost (Vo).“ Poznámka: v modelu regresní přímky „[koncentrace produktu] = m [čas] + b“ je koeficient „m“ sklon.
Opakujte kroky 1, 2 a 3 pro zbytek zkumavek v testu.
Vyneste inverzní inverzi koncentrace substrátu pro každou zkumavku proti inverzní k její počáteční reakční rychlosti (z části 1, krok 4). Například pokud je počáteční rychlost pro zkumavku s počáteční koncentrací substrátu 50 mikromolů (uM) byla 80 uM / s, inverze by byla 1/50 uM pro koncentraci substrátu a 1/80 uM / s pro počáteční rychlost. Poznámka: Inverzní koncentrace substrátu by měla být na vodorovné ose a inverzní počáteční rychlost by měla být na svislé ose.
Poznámka: Koncentrace substrátu by měla být na vodorovné ose a počáteční rychlost reakce by měla být na svislé ose.
Určete lineární regresní čáru pro graf, který jste vykreslili v části 2, krok 1. Poznámka: protože budete potřebovat znát průsečík y regresní přímky, měli byste zadat body z Sekce 2, krok 1 buď do Excelu, nebo do grafického kalkulátoru a použijte integrované regresní modelování funkčnost.
Vydělte 1 průsečíkem y od lineární regresní přímky. Získáte tak hodnotu inverzní hodnoty Vmax, maximální reakční rychlosti pro enzym. Poznámka: má-li lineární regresní model tvar „[Inverse Vo] = m [Inverse Substrate Conc.] + B,“ pak by hodnota „b“ byla průsečík y. Vydělte 1 písmenem „b“ a vypočítejte inverzní funkci k Vmax.
Vydělte 1 výsledkem z části 2, krok 3, abyste vypočítali skutečnou hodnotu Vmax.
Určete koncentraci enzymu v původním testu (viz hrubá data). Poznámka: koncentrace enzymu je stejná pro všechny zkumavky; v testu se liší pouze koncentrace substrátu.
Vydělte Vmax (z části 2, krok 4) koncentrací enzymu (z části 2, krok 5). Výsledkem je hodnota Kcat.
Andy Pasquesi, textař z Chicaga, má bohaté zkušenosti s psaním pro automobilový průmysl (BMW, MINI Cooper, Harley-Davidson), finanční služby (Ivy Funds, William Blair, T. Rowe Price, CME Group), klienti zdravotnictví (Abbott) a spotřebního zboží (Sony, Motorola, Knoll). Je držitelem titulu Bachelor of Arts v angličtině na Harvardově univerzitě, ale nestará se o Oxfordskou čárku.