След като сте пробвали ДНК проби върху агарозен гел и сте направили снимка, можете да я запазите за по-късно, след което можете да анализирате резултатите и да ги интерпретирате. Видовете неща, които търсите, ще зависят от естеството на вашия експеримент. Ако правите ДНК пръстови отпечатъци например, ще искате да сравните размера на парчета ДНК от две проби - от заподозрения и от проба на местопрестъпление, може би. Ако работите с плазмиди от бактерии, за разлика от това, може да се наложи да се уверите, че плазмидът съдържа вложката. Следователно, как интерпретирате гела си, зависи отчасти от експеримента, който сте направили. Въпреки това има някои общи правила, които можете да приложите.
Имайте предвид, че може да се наложи да използвате инструкциите в този раздел. Често се използва електрофореза с агарозен гел, за да се потвърди, че плазмидът съдържа дадена вложка. Ако не работите с плазмиди, можете да пропуснете този раздел. Ако обаче сте, можете да следвате тези инструкции.
Забележете, че ако работите с необрязани или нарязани плазмиди, не можете да изчислите размера, като използвате процедурата от раздел 1 по-горе. Това е така, защото необрязаните и обрязани плазмиди мигрират с различна скорост от линейната ДНК.
Сравнете броя ленти във всяка лента. Припомнете си, че рестрикционният ензим реже ДНК на местата, където възниква дадена последователност, наречена рестрикционно място. Ако една проба е била обработена с ДВА рестрикционни ензима, трябва да присъства лента за вмъкването и лента за останалата част от плазмида. Това е така, защото вложката ще бъде оградена от две рестрикционни места, всяко за различен ензим, така че разфасовките на двете места ще освободят вложката от плазмида. Разрезът само на едно място, за разлика от това, ще превърне плазмида в линейна ДНК. Тогава пробата, отрязана без рестрикционни ензими или един рестрикционен ензим, трябва да включва една лента, докато пробата, отрязана с два рестрикционни ензима, трябва да има две ленти.
Внимавайте за ленти, създадени от обрезната плазмидна ДНК. Нарязаният плазмид има разрез само в една верига, така че мигрира по-бавно от нарязания плазмид. Изрязаните плазмиди от своя страна мигрират по-бавно от неразрязаната ДНК.
Оценете размера на вложката, като използвате процедурата, описана в раздел 1, и определете дали отговаря на вашите очаквания (които ще варират в зависимост от експеримента.)
Неща, от които ще се нуждаете
- Молив
- Хартия
- Програма за електронни таблици
- Снимка на вашия гел
- Владетел