Живите организми често се разделят на пет царства. Многоклетъчните организми попадат в три от тези царства: растения, животни и гъби. Kingdom Protista съдържа редица организми, които понякога могат да изглеждат многоклетъчни, като водорасли, но на тези организми им липсва сложната диференциация, типично свързана с многоклетъчните организми. Организмите в тези царства изглеждат значително различни, но на клетъчно ниво те споделят a брой характеристики и обикновено се считат за много по-тясно свързани помежду си, отколкото с бактерии.
Еукариоти
Организмите могат да се характеризират с клетъчни характеристики или като прокариоти, или като еукариоти. Еукариотите притежават линейни хромозоми, мембранно свързано ядро и сложни органели. Прокариотите притежават кръгова хромозома и им липсват сложните органели и ядро, присъстващи в еукариотите. Важно е да се отбележи, че всички многоклетъчни организми са еукариоти, макар че не всички еукариоти са многоклетъчни.
Кралство Анималия
Като членове на това царство хората обикновено са много запознати с животинското царство. Освен че са многоклетъчни, животните са хетеротрофни, нямат клетъчни стени и се развиват от бластула - сфера от клетки, образувани в началото на ембрионалното развитие. Въпреки че много животни са големи, като китове и слонове, някои животни са изключително малки като акари, които живеят в веждите ни. Няколко животни са създали симбиотични взаимоотношения с автотрофи като тези, открити в коралите. Въпреки че коралите са малки поотделно, техните колективни усилия за дълги периоди от време са създали наистина масивни характеристики като Големия бариерен риф край бреговете на Австралия.
Kingrom Plantae
Kingdom Plantae - който включва мъхове, папрати, иглолистни дървета и цъфтящи растения - играе важна и основна роля в много сухоземни екосистеми като първата стъпка от много хранителни мрежи. Хлоропластите придават на растенията характерния им зелен цвят и позволяват на клетките на растенията да превръщат слънчевата светлина, водата и въглеродния диоксид в храна чрез фотосинтеза. Друга особеност на растителните клетки е клетъчната стена, съставена от целулоза. Растенията проявяват много по-голяма способност за безполово размножаване, отколкото животните. Тази способност е илюстрирана от Pando, трепетлика в Юта, която е организъм с взаимосвързана коренова система и над 47 000 стъбла, клонирани от самотен родител. Това е позволило на Пандо да оцелее преди последната ледникова епоха.
Кралски гъби
Хетеротрофни са както едноклетъчните гъби, използвани за производството на антибиотици, бира и соев сос, така и многоклетъчните версии, чиито плодни тела се появяват върху нашите пържоли. За разлика от животните, които поглъщат храната и храненето си, гъбите абсорбират енергията и хранителните си вещества от заобикалящата ги среда, като отделят ензими. Гъбите играят важна роля в околната среда като разложители, разграждайки отпадъците и мъртвите тела на други организми. Някои гъби образуват симбиотични взаимоотношения с други организми, както при лишеите (с водорасли) и микоризите (върху корените на растенията). Някои гъбички обаче могат да бъдат паразитни.
Кралство Протиста
Може да е честно да се характеризира Kingdom Protista като различно чекмедже за еукариоти. Въпреки че много протисти са едноклетъчни, многоклетъчни водорасли понякога се поставят в това царство заедно с едноклетъчните водорасли. Разликите между водораслите и растенията включват липсата на специализирани части на тялото. Може би най-яркият пример за многоклетъчни водорасли се намира в водораслите в някои крайбрежни райони. Въпреки че водораслите имат части, аналогични на корените, стъблата и листата, укрепването на водораслите няма изтънченост и специализация, открити в кореновите тъкани на растенията. Водораслите често обитават сладководна и морска среда, но също така са се приспособили към живота в почвата и лишеите. Водораслите са автотрофни, използвайки фотосинтеза, за да направят собствена храна точно като растенията.