Организмите, които живеят в среда, която би навредила или убила повечето неща, се наричат екстремофили. Когато тази екстремна среда има много ниско рН, обикновено под три, те са известни като ацидофили. Ацидофилните бактерии живеят на различни места, от отвори на дъното на морето до топлинни характеристики в Йелоустоун към човешкия стомах и всички имат приспособления, за да им помогнат да оцелеят при тежки, киселинни условия.
Helicobacter pylori
Helicobacter pylori е вид бактерии, които се намират в човешкия стомах и са отговорни за 80 до 90 процента от стомашни язви (вж. Справка 3). Той е оформен като винт с няколко бичура, които му помагат да се движи. Човешкият стомах може да има рН до две, достатъчно киселинно, за да денатурира протеините, да започне да смила храната си и да убие повечето бактерии. Helicobacter pylori е ацидофилен, но би предпочел да не харчи енергия, за да се предпази от вредното въздействие на киселината, така че прекарва голяма част от времето си заровено дълбоко в стомашната слуз. Когато трябва да се премести от място на място, той се изолира със защитен балон от буфериращ разтвор, който неутрализира киселината.
Тиобацилус ацидофилус
Thiobacillus acidophilus е пример за термоацидофил, което означава бактерия, която харесва както изключително гореща, така и изключително кисела среда. Среща се в кисели гейзерни басейни в Националния парк Йелоустоун, както и на други места. Също така е интересно, защото е способно на фотосинтеза или получаване на енергията си от слънцето. Подобно на повечето ацидофилни бактерии, той оцелява, като използва много ефективна протонна помпа, за да предотврати навлизането на твърде много водородни атоми и промяната на вътрешното рН.
Acetobacter aceti
Повечето ацидофилни бактерии използват адаптации, за да поддържат вътрешното си pH неутрално, така че киселината да не денатурира техните протеини, но Acetobacter aceti е модифицирал своите протеини, така че да не бъдат увредени от киселинни среди. Проучване в приложната микробиология на околната среда открива повече от 50 специализирани протеина, които са се развили, за да помогнат на бактерията да се справи с киселинни състояния. Цялата тази адаптация е добра за хората, тъй като ние използваме този вид за създаване на оцетна киселина или оцет, в продължение на хиляди години.
Oligotropha corboxydovorans
В дълбоките води, където не прониква светлина, термоотворите на морското дъно бълват киселина и други токсични материали. Тези отвори формират основата за невероятна екосистема. Една мида, която живее сред термоотворите, има симбиотична връзка с Oligotropha corboxydovorans. Мидата осигурява дом и бактериите консумират водород, за да произвеждат енергия и за двамата. Атомите на водорода правят системите кисели и тези бактерии са намерили начин да използват водорода и да се превърнат в миниатюрни горивни клетки.