Структурата на дезоксирибонуклеиновата киселина - ДНК - беше доказана като двойна спирала преди години, но конвенцията за именуване на всяка верига се превърна в тема на объркване както за учените, така и за студентите. Сред двойките ДНК едната се нарича Уотсън, а другата Крик, след двамата съоткриватели на ДНК. Но научната литература не е съгласна относно това, коя нишка трябва да бъде дадена на кое име. Системата за именуване на Уотсън-Крик е предназначена да показва различните функционални свойства на всяка верига в структурата на ДНК, което е същата цел на останалите системи за именуване. От решаващо значение е да се разберат различните контексти, в които отделните направления трябва да приемат различни имена. Два перфектни примера са различните им роли в репликацията или транскрипцията на ДНК. Знаейки какво прави всяка верига в биологичен процес, ще помогне да се изясни защо й е дадено това име.
Anti-Sense не е глупост
Транскрипцията е процес на копиране на ДНК в РНК. Това се прави от ензим, наречен РНК полимераза (RNA Pol). RNA Pol чете само една от двете ДНК вериги, тъй като прави молекулата на РНК. Двуверижната ДНК молекула се разделя и РНК Pol се свързва с една верига, която ще прочете и копира. Това направление се нарича шаблонно направление или антисенс направление. Произведената РНК молекула ще бъде комплементарна на матричната верига, което означава, че нуклеотидите на шаблонната верига и молекулата на РНК съвпадат помежду си съгласно правилата: аденин към урацил и гуанин към цитозин.
Това прави смисъл
Когато РНК се транскрибира от ДНК, РНК полимераза се свързва и копира шаблонната верига. Останалата верига се нарича кодираща верига (виж справка 5) или смислова верига. Като се имат предвид основните правила за сдвояване на нуклеиновите киселини (двойки А с Т и G двойки с С), кодиращата или смислова верига на ДНК има идентична последователност на тази на произвежданата РНК. Изключението тук е, че РНК съдържа нуклеотид U (урацил) вместо Т (тимин), и двата чифта с А (аденин).
Леко пътуване
Преди митоза или клетъчно делене, клетката трябва да репликира своята ДНК, така че всяка дъщерна клетка да има идентичен брой ДНК вериги. ДНК полимераза е ензимът, който копира дълги участъци от ДНК в повече ДНК. На репликационната вилица молекулата на ДНК се разархивира, за да образува мехурче, в което Полимераза се плъзга. Полимеразата се свързва с двете вериги на размотаната ДНК и започва да прави копия на двете вериги. Едно от копията е направено като единична непрекъсната нишка, която се нарича водеща нишка. Репликацията на ДНК е друг случай, когато нишките на ДНК имат различни имена.
Stop and Go Traffic
Антипаралелната структура на ДНК стълбата означава, че едната верига минава от главата до опашката, докато другата верига минава от опашката до главата. По време на репликацията на ДНК, ДНК полимеразата трябва да чете и копира и двете вериги едновременно, въпреки че те протичат в противоположни посоки. Тъй като ДНК полимеразата може да чете и копира ДНК нишки само в една посока - от опашката до главата - нишката че Полимеразата се среща като ориентирана в главата до опашката не може да се чете и копира като непрекъсната направление. Тази нишка от глава до опашка се копира като къси фрагменти, наречени фрагменти Okazaki, които по-късно се сливат, за да образуват една дълга нишка. При репликацията на ДНК веригата, която се образува на фрагменти, се нарича изоставаща верига.