Алелът е възможна кодираща последователност на ген. Често срещано погрешно схващане или дефектна терминология е, че има гени за специфични черти. Гените контролират различни черти на организма, като цвят на косата или цвят на очите, но действителното изразяване на черта зависи от това кой алел е доминиращ. Например, генът за цвета на очите при хората може да има алел за кафяви очи и алел за сини очи, или алел за кафяви очи и един за зелени очи. Хората, както и други форми на живот, които имат по две копия на всяка хромозома, също имат по две копия на всеки ген за съхраняване на алели.
Двете копия на ген, по едно на всяка от хромозомите, съдържат алел. Хомозиготността възниква, когато двете генни копия съдържат един и същ алел за определен фенотип или изразена черта. Хетерозиготността възниква, когато двата алела са различни. Фенотипите могат да бъдат доминиращи или рецесивни. Ако даден фенотип е доминиращ, трябва да присъства само един от алелите за него. Ако е рецесивен, трябва да присъстват и двата алела.
Според държавното управление на образованието в Юта, квадрат Punnett може да се използва за прогнозиране на вероятността че определен генотип ще се появи при потомството, като се вземат алелите на двамата родители и се комбинират тях. Генотипът ще повлияе на фенотипа, в зависимост от това дали алелите са доминиращи или рецесивни. Основният квадрат на Punnett е разделен на четири по-малки квадрата. Възможните гени на единия родител са изброени над горните два квадрата, а другият до него отива вертикално надолу от лявата страна. Главни букви означават доминиращи алели, а малки букви означават рецесивни алели. Например, хомозиготен доминиращ ген за кафяви очи ще бъде записан като BB, а хетерозиготен като Bb. Хомозиготен рецесивен ген ще бъде записан като bb. Като вземем буквите в съседство с всеки квадрат, за кръст Bb x Bb, вероятността за генотип BB ще бъде 25%, Bb 50% и bb 25%. По отношение на фенотипа, потомството има 75 процента шанс да има кафяви очи, тъй като кафявите очи са доминиращ фенотип, според sciencekidsathome.com.