Иглолистните дървета се отличават с два вида шишарки: поленовия конус и семенния конус. Някои иглолистни дървета имат и двата типа конуси на едно и също дърво, което прави възможно дървото да се опрашва. Кръстосаното опрашване се случва, когато едно дърво произвежда само семенни шишарки и следователно трябва да бъде оплодено чрез полени, които се отнасят към семенните шишарки от поленови шишарки, разположени на други близки дървета.
Колоните на полените са характерно по-малки и по-широки от конусите на семената. Поленовите шишарки са склонни да изсъхват и умират, след като поленът в шишарките бъде освободен, за да оплоди семенните шишарки. В своята фаза на покой иглолистната пъпка може да бъде мъжка, женска или вегетативна. Разграничаването между типовете пъпки на този етап е възможно само чрез дисекция. Една улика, която може да помогне при идентифицирането на конусови полени, е местоположението му. Конусите на семената са склонни да се развиват по-високо в дървото, за да подпомогнат разпространението, след като семената се опрашат.
Конусите на семената обикновено се използват за идентифициране на дървесния тип, тъй като те остават на или под дървото за по-дълъг период от време. Тънките пъпки на конуса на семената набъбват в продължение на четири до шест седмици, докато започват да се появяват червените или зелени яйцевидни люспи. Везните са склонни да се сгъват изправени от основата на конуса и след това да се спускат надолу, след като приемат прашеца от поленовите конуси, за да инициират развитието на семената и да сигнализират за зрялост на конуса.
Някои иглолистни дървета нямат нито цветен прашец, нито конуси от семена. Вместо това дървото произвежда плодове, които частично покриват семената. Канадският тис е пример за иглолистно дърво, произвеждащо арил, което съдържа месеста обвивка, съдържаща семената на дървото. За да се предотврати излишната загуба на семена поради хищници от животни и птици, които може да пожелаят да се хранят с плод от тис, това дърво се е адаптирало така, че плодовете му да са токсични и семената да останат необезпокояван.
Иглолистните конуси или пинофитите се класифицират като голосеменни растения (голи семена), тъй като техните яйцеклетки и семена не са затворени в яйчниците или не се намират в защитни плодови покрития. Ако иглолистното дърво има едновременно полени и семенни шишарки на едно и също дърво, то допълнително се класифицира като диплоиден спорофит. След като семената се образуват след опрашване, люспите на конуса се отварят, за да освободят семената за разпръскване по вода, вятър и движението на човека и животните.
