Биоразнообразието е ключова мярка за здравето на всяка екосистема и на цялата ни планета. Всеки организъм в една екосистема или биом разчита на други организми и физическата среда. Например, растителните и животинските видове се нуждаят един от друг за храна и зависят от околната среда за вода и подслон. Биоразнообразието описва колко разнообразие има една екосистема по отношение на ресурси и видове, а също и генетично в рамките на видовете. По-разнообразната екосистема ще разполага с повече ресурси, които да й помогнат да се възстанови от глад, суша, болести или дори изчезване на даден вид. Има няколко нива на биологично разнообразие, всяко от които показва колко разнообразни са гените, видовете и ресурсите в даден регион.
Видово разнообразие
Всяка екосистема съдържа уникална колекция от видове, всички взаимодействащи помежду си. Някои екосистеми могат да имат много повече видове от други. В някои екосистеми един вид е нараснал толкова голям, че доминира над природната общност. При сравняване на биологичното разнообразие на екосистемите, една екосистема, която има голям брой видове, но нито един вид, който не надвишава останалите, би се считала за най-много видово разнообразие. Голям брой видове могат да помогнат на една екосистема да се възстанови от екологичните заплахи, дори ако някои видове изчезнат.
Генетично разнообразие
Генетичното разнообразие описва колко тясно свързани са членовете на един вид в дадена екосистема. С прости думи, ако всички членове имат много подобни гени, видът има ниско генетично разнообразие. Поради малките си популации застрашените видове могат да имат ниско генетично разнообразие поради инбридинга. Това може да представлява заплаха за популацията, ако води до наследяване на нежелани признаци или прави вида по-податлив на болести. Наличието на високо генетично разнообразие помага на видовете да се адаптират към променящата се среда.
Екосистемно разнообразие
Регионът може да има няколко екосистеми или може да има една. Широки простори на океани или пустини биха били примери за региони с ниско екологично разнообразие. В този смисъл планински район, който има езера, гори и пасища, би имал по-високо биологично разнообразие. Регион с няколко екосистеми може да осигури повече ресурси, за да помогне на местните видове да оцелеят, особено когато една екосистема е застрашена от суша или болест.
Функционално разнообразие
Начинът, по който видовете се държат, получават храна и използват природните ресурси на една екосистема, е известен като функционално разнообразие. Като цяло се предполага, че богата на видове екосистема има високо функционално разнообразие, тъй като има много видове с много различни поведения. Разбирането на функционалното разнообразие на една екосистема може да бъде полезно за еколозите, които се опитват да запазят или възстановят повредените й, защото познаването на поведението и ролята на видовете може да сочи към липси в хранителния цикъл или липсата на екологични ниши видове.