Екосистемите на тропическите гори осигуряват дом на някои от най-гъстите и разнообразни животински общности на Земята. Въпреки това, тропическите гори постоянно се експлоатират заради богатите си ресурси. Човешки практики като добив и обезлесяване имат сериозни последици за тези местообитания, причинявайки безброй видове животни да губят домовете си с тревожна скорост.
Птици
Няколко вида тукани, папагали и други тропически птици от тропическите гори на Южна и Централна Америка са застрашени от изчезване поради дърводобив и други причини за обезлесяване. Харпийският орел, един от най-големите известни видове орел в света, процъфтява в тропическите низини от тропическите гори от южното Мексико до източната Боливия; местообитанието на тази птица непрекъснато се свива поради ясни практики на обезлесяване, както и унищожаване на местата за гнездене от индустриални практики като добив и сондажи. Загубата на местообитания също застрашава хиляди мигриращи видове птици. Тези видове пътуват на север през лятото на Северна Америка и обратно през тропиците през зимата; все повече се връщат всяка година, за да не намерят дом и / или разрушени места за гнездене.
Бозайници
Широка гама от видове бозайници губят домовете си в тропическите гори, от най-малкия гризач до най-големия хищник. Много по-големи бозайници се нуждаят от достатъчно място за изхранване и / или лов. С напредването на индустриалните практики в определени райони бозайниците от тропическите гори като горили, ягуари и пуми трябва да се ограничат до фрагментирани местообитания с недостатъчни ресурси. Обезлесяването засяга най-пряко дървесните бозайници (тези, които живеят на дърветата), като летящата катерица и плодовия прилеп, както и няколко вида маймуни. Цели общности остават без дом, принуждавайки ги да се адаптират към безлесна среда, за която не са подготвени.
Влечуги и земноводни
Обезлесяването е основната причина за загубата на местообитания за повечето влечуги от тропическите гори, докато много видове земноводни също губят домовете си поради практики за сондиране и добив на нефт, които замърсяват езера, реки и потоци, принуждавайки ги да намират нови източници на вода за своя полуводен начин на живот. Заплашените и застрашени видове влечуги и земноводни включват златната крастава жаба, мадагаскарският гекон и игуаните, както и няколко вида отровни жаби, най-вече тези от Колумбия.