Enzimler, işlevlerini ancak üç boyutlu şekilleri bozulmadığında gerçekleştiren proteinlerdir. Bu nedenle, enzimlerin yapısını anlamak, enzim aktivitesinin hangi yollarla inhibe edilebileceğini netleştirmeye yardımcı olacaktır. Erime veya donma gibi şiddetli sıcaklık değişiklikleri, enzimlerin şeklini ve aktivitesini değiştirebilir. Enzimin çevresinin pH'ındaki veya asitlik seviyesindeki değişiklikler de enzim aktivitesini değiştirebilir.
Formda Kal
Enzimler proteinlerdir, yani katalitik aktivitelerini tanımlayan belirli bir üç boyutlu yapıya sahiptirler. Bir proteinin birincil yapısı onun amino asit dizisidir. Proteinlerin ikincil yapısı, amino asit dizisinin omurgası boyunca meydana gelen hidrojen bağıdır. Bir enzimin aktivitesinin geldiği bir proteinin üçüncül yapısı, amino asit yan zincirlerinin molekül içi (bir molekül içinde) etkileşimleri tarafından yerinde tutulur. Bir enzimin üçüncül yapısını koruyan etkileşimler, sıcaklık ve pH'dan etkilenir.
Erime
Enzimler, atomlardan oluşan amino asit zincirlerinden oluşur. Atomlar ve moleküller doğal olarak titreşir, ancak çok fazla titreşim enzimlerin açılmasına neden olur. Enzim aktivitesini engelleyen bir tür sıcaklık değişikliği ısıtmadır. Sıcaklığın artması moleküllerin daha hızlı titreşmesine neden olur. Ancak sıcaklık çok arttığında enzim açılır. Denatürasyon adı verilen bu açılma, enzimin üç boyutlu şeklini ve dolayısıyla aktivitesini kaybetmesine neden olur. Çoğu hayvan enzimi, 40 santigrat derecenin üzerinde işlevsel değildir.
Dondurucu
Enzim aktivitesini etkileyen ikinci tip sıcaklık değişimi soğutma veya dondurmadır. Sıcaklığın artması molekülleri daha hızlı titreştirdiği gibi, sıcaklığı düşürmek de titreşimleri yavaşlatır. Enzimlerdeki atomlar çok yavaşladığında veya donarsa enzim işlevini yerine getiremez. Enzimler, fiziksel bir yapıya sahip olmalarına rağmen katı makineler değildir. Enzimlerdeki atomlar, diğer proteinler gibi normalde titreşir. İşlevlerini yerine getirmek için bu esnekliğe ihtiyaçları var ve donma onları hareket etmekten alıkoyuyor.
pH
Sıcaklık değişikliklerinin yanı sıra, enzim ortamının asitliği veya pH'ındaki bir değişiklik, enzim aktivitesini engelleyecektir. Bir enzimin üçüncül yapısını bir arada tutan etkileşim türlerinden biri de amino asit yan zincirleri arasındaki iyonik etkileşimlerdir. Pozitif yüklü bir amin grubu, negatif yüklü bir asit grubuyla etkileşime girdiğinde nötralize edilir. Proton miktarındaki bir değişiklik olan pH'daki bir değişiklik, bu iki grubun yüklerini değiştirerek birbirlerini çekmemelerine neden olabilir. Her enzimin, bazılarının çok asidik ortamları, bazılarının ise çok alkalin veya bazik ortamları seven belirli bir pH aralığında çalıştığına dikkat edilmelidir.