Bir alel, bir genin olası bir kodlama dizisidir. Yaygın bir yanlış anlama veya kusurlu terminoloji, belirli özellikler için genlerin olduğudur. Genler, bir organizmanın saç rengi veya göz rengi gibi farklı özelliklerini kontrol eder, ancak bir özelliğin gerçek ifadesi, hangi alelin baskın olduğuna bağlıdır. Örneğin, insanlarda göz rengi geninin kahverengi gözler için bir aleli ve mavi gözler için bir aleli veya kahverengi gözler için bir aleli ve yeşil gözler için bir alel olabilir. Her bir kromozomun iki kopyasına sahip olan diğer yaşam formlarının yanı sıra insanlar da alelleri depolamak için her bir genin iki kopyasına sahiptir.
Bir genin iki kopyası, her bir kromozomda birer tane olmak üzere, her biri bir alel içerir. Homozigotluk, iki gen kopyası belirli bir fenotip veya ifade edilen özellik için aynı alel içerdiğinde ortaya çıkar. Heterozigotluk, iki alel farklı olduğunda ortaya çıkar. Fenotipler baskın veya çekinik olabilir. Bir fenotip baskın ise, onun için alellerden sadece birinin mevcut olması gerekir. Çekinik ise, her iki alelin de mevcut olması gerekir.
Utah Eyalet Eğitim Dairesi'ne göre, olasılığı tahmin etmek için bir Punnett karesi kullanılabilir. iki ebeveynin alellerini alarak ve birleştirerek yavrularda belirli bir genotipin oluşacağını onları. Genotip, alellerin baskın veya çekinik olmasına bağlı olarak fenotipi etkileyecektir. Temel Punnett karesi dört küçük kareye bölünmüştür. Bir ebeveynin olası genleri, üstteki iki karenin üzerinde listelenir, diğeri ise onun yanında dikey olarak sol tarafa doğru iner. Büyük harfler baskın alelleri, küçük harfler çekinik alelleri gösterir. Örneğin, kahverengi gözler için homozigot baskın bir gen BB olarak ve heterozigot bir gen Bb olarak yazılacaktır. Homozigot çekinik bir gen bb olarak yazılır. Her kareye bitişik harfler alındığında, bir Bb x Bb çaprazı için, bir BB genotipinin olasılığı yüzde 25, Bb yüzde 50 ve bb yüzde 25 olacaktır. Sciencekidssathome.com'a göre, fenotip açısından, yavruların kahverengi gözlere sahip olma şansı yüzde 75'tir, çünkü kahverengi gözler baskın bir fenotiptir.