Fosiller, korunma süreçlerine göre beş türe ayrılabilir. Bir organizma tortu tarafından gömüldüğünde, tortu kayaya dönüşürse geride bir fosil bırakabilir. Organizmaların kayada bıraktığı izler, canlının doku ve iskeleti gibi özgün materyalleri değildir. Organik materyal, jeolojik zaman içinde değiştirilir, dönüştürülür veya çözülür.
permineralizasyon
Bir organizma gömüldükten sonra, boş alanlar yeraltı suyu tarafından işgal edilebilir. Su mineraller açısından zenginse, çökelecek veya organizma ile aynı şekilde kristalleşecektir. Kristaller, çözünen organizmayı doldurur ve değiştirir. Organizma yavaş yavaş bozunursa, daha yüksek ayrıntı düzeyi sağlayan daha fazla kristal oluşabilir.
Kalıplar ve Dökümler
Çoğu zaman, organizma, çözünme veya bozunma yoluyla zamanla tamamen ortadan kalkar. Organizma kaybolurken oluşan boşluklar tortu ile dolabilir. Organizma bir kez gittiğinde, kayada yalnızca bir izlenim kalır. Bir fosil, bir organizmanın dışının olumsuz bir iziyse, o zaman bir küf oluşur. Organizma tortu ile doldurulursa, o zaman bir dökümdür.
yeniden kristalleşme
Organik materyal kaldırılmazsa, fosilin bir parçası olacak şekilde değiştirilebilir. Sedimentin içine gömülmesinden kaynaklanan ısı ve basınç, organizmadan gelen orijinal materyalin yapısını değiştirebilir. Kemiklerdeki kalsiyum, kalsit veya aragonite yeniden kristalleşebilir. Bir organizmada yeniden kristalleşen bileşikler, yeni mineraller oluşturmak üzere yeniden düzenlenir. Yeniden kristalleşme en çok kalsiyum içeriği yüksek kemiklerde veya kabuklarda meydana gelir.
karbonizasyon
Canlılar büyük miktarda karbon içerir. Gömüldüklerinde ve sıkıştırıldıklarında orijinal organizmanın koyu siyah kalıplarına dönüşebilirler. Yoğun ısı ve basınç, fosili ezer ve deforme eder. Yeterli ısı ve basınç ile kömür oluşur. Bitki yaprak fosilleri, bozulmamış halde bulunur, ancak yassı oldukları ve iki boyutlu oldukları için kömürleşmiştir. Malzeme karbonizasyon ile uzaklaştırılmaz, ancak değiştirilir.
biyoimmürasyon
Yaşam formları bazen birbirinin üzerinde büyür. Mercan gibi deniz yaşamı, diğer mercan veya deniz süngeri parçalarını sıklıkla tüketen veya çevreleyen iç içe geçmiş yapılar oluşturur. Kendileri ayrı fosiller olan mercan fosil kalıntılarının içinde kalıplar veya boşluklar kalabilir. Sert kabuğu olmayan bir organizma, kendisini çevreleyen daha büyük yaratıkta boş alanlar bırakacaktır.