Filipinler, ekonomiye ve yerel topluluklara katkıda bulunan birçok doğal kaynağa sahip, biyoçeşitlilik ve endemizm açısından zengin bir ülkedir. Kıyı şeridi ve kıyı habitatları, tamamı ülkenin su yollarına ve deniz ortamına bağlı olan balıkçılık, tarım ve sanayi ile özellikle önemlidir. Habitat ve biyoçeşitlilik kaybına yönelik tehditler, arazi temizleme, sürdürülemez balıkçılık ve kirlilik dahil olmak üzere çeşitli uygulamalardan kaynaklanmaktadır.
Orman Örtüsü Kaybı
2000 ve 2005 yılları arasında Filipinler, bir yılda orman örtüsünün yüzde ikisinden biraz fazlasını kaybetti. Bu, Güneydoğu Asya'daki en yüksek ikinci oran oldu. 2005 itibariyle, birincil ormanın sadece yüzde üçünün kaldığı düşünülüyordu. Hızlı ormansızlaşma, biyolojik çeşitlilik kaybı, toprak erozyonu, sel, toprak kaymaları ve düşük su kalitesi dahil olmak üzere ekosistem için çeşitli tehditlerle sonuçlanır. Ormanlar ticari madencilik ve ağaç kesimi tehdidi altındadır.
Mercan Resiflerinin Bozulması
Filipinler, deniz kıyı şeridi biyoçeşitliliği için küresel bir merkezdir. Mercanların ve canlı resif balıklarının yasa dışı toplanması ve ihracı, biyolojik çeşitlilik, mercan resifi durumu, deniz otu örtüsü ve balık sayıları üzerinde önemli zararlı etkilere neden olmuştur. Resiflerin sadece yüzde 5'i yüzde 75'in üzerinde canlı mercan örtüsünü koruyor. Aşırı avlanma, trol balıkçılığı, dinamit balıkçılığı ve siyanür balıkçılığı gibi yıkıcı balıkçılık uygulamaları, Siyanürün suda çözülüp resiflere fışkırtıldığı, diğer tehditlerin ise kirlilik ve erozyon.
Mangrovlara yönelik tehditler
Mangrovlara yönelik tehditler arasında aşırı hasat, kirlilik ve tarım ve insan yerleşimi için arazi temizliği yer alıyor. Karides yetiştiriciliği, bölgeye neredeyse geri döndürülemez ve ekonomik olarak maliyetli zararlar verir; bu, karides çiftliklerinin sadece üç ila beş yıl sonra kârsız hale gelmesinden daha da endişe vericidir. Resifler, mangrovların üzerinde büyüdüğü ince tortuları yıkayan güçlü dalgalara ve akıntılara karşı koruduğu için, mangrov tahribi mercan resifinin bozulmasıyla da bağlantılıdır.
Biyolojik çeşitliliğin kaybı
Filipinler bir megabiyoçeşitlilik ülkesi olarak kabul edilir. Çok sayıda eşsiz flora ve faunaya sahiptir; aslında, karasal omurgalılarının neredeyse yarısı ve damarlı bitkilerinin yüzde 60'ına kadarı ülkeye özgüdür. Biyoçeşitlilik kaybının oranı, bazı şok edici bulgulara yansıyor. 2006 itibariyle, omurgalı türlerinin yüzde 20'sinden biraz fazlası Uluslararası Doğayı Koruma Birliği tarafından tehdit altında olarak derecelendirildi. Yaklaşık 127 kuş türü tehdit altında kabul ediliyor ve bir zamanlar yaygın olan yerli Filipin kakadusu artık kritik derecede tehlikede.