แม้ว่ากล้องจุลทรรศน์แบบใช้แสงจะมีราคาไม่แพงเมื่อเทียบกับกล้องจุลทรรศน์อิเล็กตรอน แต่ก็อาจมีค่าใช้จ่ายสูงสำหรับโรงเรียน กล้องจุลทรรศน์แบบใช้แสงสามารถเพิ่มรายละเอียดของวัตถุได้ถึง 1,000 ชิ้น ซึ่งเป็นประโยชน์สำหรับชั้นเรียนชีววิทยาที่ศึกษาจุลินทรีย์ การดูแลกล้องจุลทรรศน์ทำให้แน่ใจได้ว่ากล้องจุลทรรศน์จะคงอยู่ได้นานหลายทศวรรษ ช่วยประหยัดเงินโรงเรียนได้มาก
โฮลดิ้ง
ทุกอย่างในกล้องจุลทรรศน์แบบใช้แสงมีราคาแพงมาก ดังนั้นนักเรียนควรระมัดระวังเมื่อใช้ส่วนใดส่วนหนึ่งของกล้องจุลทรรศน์แบบใช้แสง เมื่อถือกล้องจุลทรรศน์แบบใช้แสง ผู้ดูแลต้องวางมือข้างหนึ่งไว้บนฐานตลอดเวลา เพื่อหลีกเลี่ยงการทำตก ในขณะที่มืออีกข้างควรจับที่แขน ไม่ควรถือกล้องจุลทรรศน์กลับหัว เนื่องจากตาจะหลุดออกมา ตามที่มหาวิทยาลัยไมอามี่ ไม่ควรเหวี่ยงเมื่อถือ
ถอดปลั๊ก
ควรถอดปลั๊กไมโครสโคปแบบใช้แสงออกหลังการใช้งานและควรปิดฝาไว้ ปิดไฟเมื่อไม่ใช้งาน เนื่องจากหลอดไฟมีอายุการใช้งานจำกัดและต้องเปลี่ยนใหม่มีราคาแพง เนื่องจากบางคนอาจเลือกที่จะขโมยและขายกล้องจุลทรรศน์แบบผสม พวกเขาจึงควรล็อกไว้ในที่ที่ปลอดภัยเมื่อไม่ใช้งาน ควรพันสายไฟไว้รอบๆ กล้องจุลทรรศน์อย่างแน่นหนา เพื่อไม่ให้มีสิ่งใดมาจับได้
การดูแลเลนส์
เลนส์ออปติคัลมีความละเอียดอ่อนมากและสามารถเกิดรอยขีดข่วนได้โดยกระดาษเกือบทุกรูปแบบ ดังนั้นผู้ปฏิบัติงานจึงควรใช้กระดาษเลนส์เมื่อทำความสะอาดเลนส์เท่านั้น นอกจากนี้ น้ำยาทำความสะอาดจะต้องไม่ใช้ของเหลวใดๆ บนเลนส์ ตามที่ Bates College กล่าว เมื่อซูมภาพตัวอย่าง นักศึกษาต้องปรับเลนส์ใกล้วัตถุ การปรับจะทำให้เคลื่อนเข้าใกล้ชิ้นงานทดสอบมากขึ้น ดังนั้นการปรับให้เร็วเกินไปอาจทำให้มันชนเข้ากับสไลด์ ซึ่งอาจทำให้ทั้งสไลด์และเลนส์แตกได้ สไลเดอร์และสลิปทำจากแก้วจึงจะตัดคนได้เมื่อหัก สไลด์แก้วที่ร้าวควรทิ้งทันที
ความปลอดภัยของสายไฟ
สายไมโครสโคปสามารถจับได้ด้วยเท้าของใครบางคน ดึงกล้องจุลทรรศน์ลงไปที่พื้นซึ่งมันจะหักได้ ดังนั้นผู้ใช้ควรทราบตำแหน่งของสายไฟอยู่เสมอ ผู้ใช้ควรดึงสายไฟที่ปลั๊กเมื่อดึงออกจากเต้าเสียบ แทนที่จะดึงด้วยสายไฟ ซึ่งจะทำให้เกิดความเสียหายได้