นักวิทยาศาสตร์มีความสามารถในการจัดลำดับโมเลกุลดีเอ็นเอ กล่าวอีกนัยหนึ่ง พวกเขาสามารถกำหนดลำดับของเบสนิวคลีโอไทด์ในโมเลกุลที่กำหนด การหาลำดับโมเลกุลดีเอ็นเออาจเป็นขั้นตอนแรกในหลายๆ ขั้นตอนที่จำเป็นในการหาว่าโมเลกุลดีเอ็นเอจำเพาะนั้นเป็นอย่างไร นิวคลีโอไทด์ในโมเลกุลดีเอ็นเอมีปฏิสัมพันธ์ระหว่างกันและกำหนดลักษณะเฉพาะที่แตกต่างกันใน สิ่งมีชีวิต กระบวนการจัดลำดับ DNA ค่อนข้างเกี่ยวข้อง แต่ตัวจัดลำดับ DNA อัตโนมัติกำลังลดการมีส่วนร่วมของมนุษย์ที่จำเป็น อย่างน้อยก็เป็นส่วนหนึ่งของกระบวนการ
การเตรียมตัวอย่าง
เพื่อให้ซีเควนเซอร์ดีเอ็นเออัตโนมัติทำงาน จะต้องตรวจหาเบสนิวคลีโอไทด์สี่เบสที่ประกอบเป็นดีเอ็นเอ: อะดีนีน กัวนีน ไทมีน และไซโตซีน นักวิทยาศาสตร์คัดลอกชิ้นส่วนของ DNA หลายครั้งและใช้เอ็นไซม์จำกัดเพื่อตัด DNA เป็นชิ้นขนาดต่างๆ จากนั้นจึงเพิ่มเบสที่ติดฉลากเรืองแสงจำนวนเล็กน้อยลงใน DNA แต่ละชุด เบสซึ่งก็คืออะดีนีน ไทมีน กัวนีน หรือไซโตซีน จะเกาะติดกับส่วนประกอบฐานของมันที่ปลายเกลียว ตัวอย่างเช่น อะดีนีนจะจับกับเส้นใยที่ลงท้ายด้วยไทมีน และกวานีนจะจับกับเส้นใยที่ลงท้ายด้วยไซโตซีน
การสร้างลำดับดีเอ็นเออัตโนมัติ
ซีเควนเซอร์ดีเอ็นเออัตโนมัติถูกสร้างขึ้นเหมือนกับซีเควนเซอร์ดีเอ็นเอที่ต้องการแรงงานมากขึ้น โดยเฉพาะอย่างยิ่ง ซีเควนเซอร์ดีเอ็นเออัตโนมัติคือแท็งก์ที่มีความยาวประมาณ 1 ฟุต มีหลุมเจล 96 หลุม ซึ่งสามารถเทดีเอ็นเอลงไปได้ ในซีเควนเซอร์ดีเอ็นเออัตโนมัติ เช่นเดียวกับในซีเควนเซอร์ดีเอ็นเอใดๆ ดีเอ็นเอจะถูกฉีดเข้าไปในหลุมเจลที่ด้านบนของถัง และประจุลบจะถูกนำไปใช้กับส่วนปลายของถัง ประจุลบเป็นแรงผลักดันให้สาย DNA เดินทางในระยะทางที่ต่างกันไปจนสุดปลายถัง
ฉีดอัตโนมัติ
ซีเควนเซอร์ DNA อัตโนมัติจะฉีด DNA จำนวนมากเข้าไปในส่วนบนของเจลโดยอัตโนมัติ ด้วยเหตุนี้จึงช่วยประหยัดเวลาและความพยายามของนักวิจัยได้อย่างมาก หลังจากที่ฉีดเข้าไปในแบทช์แล้ว ซีเควนเซอร์จะใช้ประจุลบที่ปลายด้านหนึ่งของถังโดยอัตโนมัติ ทำให้เส้นใยเคลื่อนตัวในระยะทางที่แตกต่างกันผ่านเจล ระยะทางที่แตกต่างกันสะท้อนถึงขนาดต่างๆ ของสาย DNA ที่ผ่านเจล
เครื่องตรวจจับ
เครื่องหาลำดับดีเอ็นเออัตโนมัติจำนวนมากได้รับการตั้งค่าให้ตรวจจับสีย้อมเรืองแสงบนสาย DNA ที่ผ่านเจล ในการทำเช่นนั้น พวกมันสามารถระบุนิวคลีโอไทด์ที่ปลายเกลียวและบันทึกลงในคอมพิวเตอร์ อย่างไรก็ตาม อย่างดีที่สุด ซีเควนเซอร์นำเสนอ DNA nucleotides เวอร์ชันที่สับสน หลังจากใช้เครื่องหาลำดับดีเอ็นเออัตโนมัติแล้ว คุณต้องผ่านกระบวนการที่เรียกว่า "การตกแต่ง" ซึ่งเป็นการผสมผสานระหว่างคอมพิวเตอร์ และนักวิจัยแยกแยะผลลัพธ์จากการตรวจจับสาย DNA เพื่อรวบรวมข้อมูลให้เป็นคำอธิบายที่ครอบคลุมของ DNA สาระ ไม่น่าแปลกใจที่กระบวนการนี้อาจใช้เวลานานกว่ากระบวนการจัดลำดับจริงมาก