เซลล์พืชและเซลล์สัตว์มีความคล้ายคลึงกันในหลาย ๆ ด้าน แต่ก็แตกต่างกันไปในเซลล์อื่นๆ เซลล์พืชสามารถสังเคราะห์แสงได้ เช่น ในขณะที่เซลล์สัตว์ไม่สามารถสังเคราะห์แสงได้ ความแตกต่างที่สำคัญอย่างหนึ่งระหว่างเซลล์พืชและเซลล์สัตว์เกี่ยวข้องกับโครงสร้างที่เรียกว่าแฟลเจลลา
แฟลกเจลลาเป็นโครงสร้างคล้ายหางหรือแส้ที่ยื่นออกมาจากเซลล์สัตว์บางชนิด ตัวอย่างที่คุ้นเคยที่สุดน่าจะเป็นแฟลเจลลัมที่ยาวเป็นพิเศษที่พบในเซลล์อสุจิ แฟลเจลลัมจะขับเซลล์ไปข้างหน้าและกระตุ้นการเคลื่อนที่ของเซลล์ด้วยการฟาดไปมา
เซลล์พืชส่วนใหญ่ขาดแฟลกเจลลา พวกเขาไม่จำเป็นต้องเคลื่อนไหวและด้วยเหตุนี้จึงไม่จำเป็นต้องใช้วิธีการขับเคลื่อนนี้ อย่างไรก็ตาม พืชบางชนิดผลิตสเปิร์มแฟลกเจลลาที่สามารถว่ายผ่านน้ำไปถึงไข่ได้ ดังนั้น เซลล์พืชโดยทั่วไปจะขาดแฟลเจลลา แม้ว่าเซลล์สเปิร์มของพืชจะถูกแฟลกเจลลา
ตามบทความในวารสาร "Plant Physiology" ในปี 2544 เชื่อว่าบรรพบุรุษของพืชสมัยใหม่ถูกแฟลกเจลลา เซลล์พืชสูญเสียความสามารถในการประกอบแฟลกเจลลาระหว่างการวิวัฒนาการ