DNA มีวิธีการซ่อมแซมมากมาย หนึ่งต้องเกิดขึ้นในแสงสว่าง และหลายอย่างสามารถเกิดขึ้นได้ในความมืด กลไกเหล่านี้แตกต่างไปตามว่าเอนไซม์ที่จำเป็นในการดำเนินการนั้นได้รับพลังงานจากดวงอาทิตย์หรือไม่
DNA สองเบสสามารถเชื่อมขวางได้เมื่อมีแสงยูวี การเชื่อมโยงข้ามนี้จะป้องกันไม่ให้กระบวนการของเซลล์ต่างๆ เกิดขึ้น รวมถึงการจำลองดีเอ็นเอ
ในการซ่อมแซมด้วยแสง เอนไซม์ที่เรียกว่า photolyase จะแยก DNA ที่เชื่อมขวางซึ่งเกิดจากความเสียหายจากรังสียูวี Photolyase ต้องการพลังงานจากดวงอาทิตย์
ปฏิกิริยาของความมืดใช้เอ็นไซม์ที่เรียกว่า N-glycosylase เพื่อแยก cross-links ใน DNA โดยเฉพาะอย่างยิ่ง N-glycosylase ไม่ต้องการพลังงานจากดวงอาทิตย์
การซ่อมแซมแบบรีคอมบิเนชั่นยังเป็นกลไกการซ่อมแซม DNA ที่ไม่ต้องการแสงอีกด้วย กลไกการจำลองแบบดีเอ็นเอไม่สามารถจำลองแบบข้ามฐานดีเอ็นเอที่เชื่อมโยงข้ามได้ อย่างไรก็ตาม มันสามารถข้ามได้ โดยทิ้งช่องว่างไว้ ช่องว่างนี้สามารถเติมเต็มได้ด้วยโครโมโซมตรงข้ามหลังจากการจำลองแบบ แต่ก่อนที่จะเกิดการแบ่งตัวของเซลล์ กระบวนการนี้เรียกว่าการรวมตัวของโฮโมโลกัสอีกครั้งและไม่ต้องการแสง
การซ่อมแซมการตัดตอนเกิดขึ้นเมื่อคู่เบสที่เชื่อมขวางถูกรับรู้โดยคอมเพล็กซ์โปรตีนที่เอาเบสหลายตัวที่ทอดก่อนและหลังการเชื่อมขวางออก หลังการกำจัด DNA จะถูกจำลองอย่างถูกต้องโดยใช้เกลียวที่ไม่บิดเบี้ยวเป็นแม่แบบ