โดยทั่วไปแล้วถุงเก็บขยะสีแดงจะสงวนไว้สำหรับของเสียทางการแพทย์ แต่ก็สามารถนำมาใช้สำหรับการแปรรูปอาหารหรือขยะเทคโนโลยีชีวภาพที่มีสารที่อาจก่อให้เกิดการติดเชื้อได้ วัสดุเหล่านี้รวมถึงถุงมือหรืออุปกรณ์ป้องกันส่วนบุคคลอื่น ๆ ที่มีเลือดหรือของเหลวในร่างกายอื่น ๆ รวมทั้งตัวอย่างวัฒนธรรมของมนุษย์หรือสัตว์ ของเสียจากวัฒนธรรมอื่นหรือสารติดเชื้อสามารถใส่ในถุงสีแดงที่ปลอดเชื้อ
สิ่งของหลายชิ้นไม่ควรใส่ลงในถุงเก็บอันตรายทางชีวภาพสีแดง ตามที่ Stericycle ผู้ผลิตถุงปลอดเชื้อระบุในโพสต์ "คำถามที่พบบ่อยเกี่ยวกับการกำจัดขยะทางการแพทย์และของมีคม" รายการเหล่านี้ ได้แก่ ถังอัดแก๊ส ของมีคม ของเสียเคมี กากกัมมันตภาพรังสี สารตรึง สารกันบูด ของเสียในครัวเรือนหรืออาหาร และขยะเทคโนโลยีชีวภาพหรือเศษอาหารที่ไม่มีการติดเชื้อ ตัวแทน ในเขตอำนาจศาลบางแห่ง ขยะอันตรายทางชีวภาพที่เป็นของเหลวสามารถฆ่าเชื้อแล้วทิ้งเข้าสู่ระบบท่อระบายน้ำ เขตอำนาจศาลบางแห่งใช้ถุงใสปลอดเชื้อเพื่อกำจัดยาหรือสารควบคุมอื่นๆ
ควรจัดการถุงที่เป็นอันตรายต่อสิ่งมีชีวิตสีแดงด้วยความระมัดระวัง ควรใช้ถุงพร้อมใช้หรือถุงที่ใช้เป็นถุงรองในภาชนะรอง ควรใช้ภาชนะแข็งที่มีฝาปิดแน่น ภาชนะไม่ควรทำจากกระดาษแข็งหรือมีฝาแกว่งตาม Stanford School of Medicine ในบทความเว็บไซต์ "Medical Waste Inspection รายการตรวจสอบ" ทุกด้านและฝาของภาชนะรองควรทำเครื่องหมายว่า "ขยะชีวภาพ" ภาชนะรองควรทำเครื่องหมายตามรัฐและรัฐบาลกลาง กฎระเบียบ
ในการขนย้ายถุงปลอดสารชีวภาพทั้งหมดเพื่อนำไปทิ้ง ควรสวมใส่อุปกรณ์ป้องกันส่วนบุคคลที่เหมาะสม รวมทั้งเสื้อกาวน์แล็บ แว่นตานิรภัย และถุงมือยาง หลีกเลี่ยงการสัมผัสลูกบิดประตูและพื้นผิว ถ้าเป็นไปได้ ควรย้ายถุงไปยังถังเก็บขยะที่เหมาะสมที่ใกล้ที่สุด หากถุงรั่ว ควรใส่ไว้ในตู้คอนเทนเนอร์รองทันที หลังจากจัดการถุงเต็มเพื่อกำจัดทิ้งแล้ว ควรถอดถุงมือและล้างมืออย่างถูกวิธี ภาชนะรองควรทำความสะอาดและฆ่าเชื้ออย่างสม่ำเสมอ
