กล้องจุลทรรศน์อิเล็กตรอนแบบส่องกราด (TEM) และกล้องจุลทรรศน์อิเล็กตรอนแบบส่องกราด (SEM) เป็นวิธีการทางกล้องจุลทรรศน์สำหรับการดูตัวอย่างที่มีขนาดเล็กมาก สามารถเปรียบเทียบ TEM และ SEM ได้ในวิธีการเตรียมตัวอย่างและการประยุกต์ใช้งานของแต่ละเทคโนโลยี
กล้องจุลทรรศน์อิเล็กตรอนทั้งสองประเภทยิงตัวอย่างด้วยอิเล็กตรอน TEM เหมาะสำหรับศึกษาด้านในของวัตถุ การย้อมสีให้คอนทราสต์และการตัดจะให้ชิ้นงานที่บางเป็นพิเศษสำหรับการตรวจสอบ TEM เหมาะอย่างยิ่งสำหรับการตรวจไวรัส เซลล์ และเนื้อเยื่อ
ตัวอย่างที่ตรวจสอบโดย SEM จำเป็นต้องมีการเคลือบที่เป็นสื่อกระแสไฟฟ้า เช่น ทองคำ-แพลเลเดียม คาร์บอน หรือแพลตตินั่ม เพื่อรวบรวมอิเล็กตรอนส่วนเกินที่จะบดบังภาพ SEM เหมาะอย่างยิ่งสำหรับการดูพื้นผิวของวัตถุ เช่น มวลรวมโมเลกุลขนาดใหญ่และเนื้อเยื่อ
ปืนอิเล็กตรอนสร้างกระแสอิเล็กตรอนที่โฟกัสด้วยเลนส์คอนเดนเซอร์ ลำแสงควบแน่นและอิเล็กตรอนที่ส่งผ่านจะถูกโฟกัสโดยเลนส์ใกล้วัตถุลงในภาพบนหน้าจอภาพฟอสเฟอร์ บริเวณภาพที่มืดกว่าบ่งชี้ว่ามีการส่งอิเล็กตรอนน้อยลงและพื้นที่เหล่านั้นหนาขึ้น
เช่นเดียวกับ TEM ลำแสงอิเล็กตรอนถูกผลิตและควบแน่นด้วยเลนส์ นี่คือเลนส์สำหรับหลักสูตร SEM เลนส์ตัวที่สองสร้างอิเล็กตรอนให้เป็นลำแสงที่บางและแน่น ชุดขดลวดสแกนลำแสงในลักษณะเดียวกับโทรทัศน์ เลนส์ตัวที่สามนำลำแสงไปยังส่วนที่ต้องการของชิ้นงานทดสอบ ลำแสงสามารถอยู่บนจุดที่กำหนดได้ ลำแสงสามารถสแกนชิ้นงานทดสอบทั้งหมดได้ 30 ครั้งต่อวินาที