ความสัมพันธ์ระหว่างสัตว์ต่าง ๆ ถูกสร้างขึ้นผ่านอนุกรมวิธาน อนุกรมวิธานคือการจำแนกประเภทของสิ่งมีชีวิต การจำแนกประเภทเหล่านี้แบ่งออกได้ดังนี้จากการจัดกลุ่มที่ใหญ่ที่สุดไปจนถึงสัตว์แต่ละชนิด: อาณาจักร ไฟลัม ไฟลัมย่อย คลาส ลำดับ ครอบครัว สกุล สปีชีส์ สัตว์ที่อยู่ในสายพันธุ์เดียวกันนั้นสัมพันธ์กันอย่างใกล้ชิด และสัตว์ในอาณาจักรเดียวกันนั้นสัมพันธ์กันอย่างห่างไกล ตัวอย่างเช่น สัตว์ทั้งหมดเป็นส่วนหนึ่งของอาณาจักรเดียว Animalia และพืชทั้งหมดอยู่ในอาณาจักร Plantea
แมงมุมและปูทั้งหมดอยู่ในไฟลัมอาร์โธโพเดีย เช่นเดียวกับแมลงทุกชนิด สัตว์ขาปล้องมีความโดดเด่นด้วยความจริงที่ว่าพวกมันทั้งหมดมีขาปล้องและมีโครงกระดูกภายนอก แม้ว่าปูและแมงมุมจะจัดอยู่ในไฟลัมเดียวกัน แต่ก็ไม่ได้หมายความว่าปูและแมงมุมจะมีความเกี่ยวข้องกันอย่างใกล้ชิด ตัวอย่างเช่น สัตว์ที่มีกระดูกสันหลังทั้งหมดอยู่ในไฟลัมคอร์ดาต้า แต่เป็นที่ชัดเจนว่าแม้ว่าปลาและลิงทั้งคู่จะมีหนาม แต่ก็แตกต่างกันมาก
การแบ่งตัวระหว่างแมงมุมกับปูส่วนใหญ่เกิดขึ้นที่ระดับย่อย แมงมุมอยู่ใน subphylum Cheilcerata ในขณะที่ปูส่วนใหญ่อยู่ใน subphylum Mandibulata ความแตกต่างคือส่วนใหญ่ปูมีขากรรไกรล่าง ชนิดของกราม และแมงมุมมี chelicerae ซึ่งเป็นส่วนปากที่ปรากฏก่อนปาก “เขี้ยว” ของแมงมุมคือ chelicerae
แมงดาทะเลอยู่ในกลุ่มย่อยเดียวกับแมงมุม Cheilcerata สิ่งนี้ทำให้แมงดาทะเลมีความเกี่ยวข้องกับแมงมุมมากกว่าปูอื่นๆ เช่นเดียวกับแมงมุม แมงดาทะเลไม่มีขากรรไกรล่าง แต่มี chelicerae อยู่ด้านหน้าปากของมันแทน แมงดาและแมงดาทะเลแบ่งตามระดับชั้นเรียน แมงมุมอยู่ในกลุ่ม Arachnida ในขณะที่แมงดาทะเลอยู่ในกลุ่ม Merostomata
สิ่งมีชีวิตที่มีลักษณะเหมือนปูอีกตัวหนึ่งเคยมีอยู่และจัดอยู่ในกลุ่มย่อย Cheilcerata สิ่งเหล่านี้เรียกว่า "แมงป่องทะเล" พวกเขาสูญพันธุ์ไปเมื่อประมาณ 250 ล้านปีก่อน “แมงป่อง” เหล่านี้มีเหล็กในขนาดใหญ่กว่าหางและยาวกว่า 6 ฟุต นี่ทำให้พวกเขาอาจเป็นสัตว์ขาปล้องที่ใหญ่ที่สุดเท่าที่เคยมีมา การรวมพวกมันไว้ในกลุ่มย่อย Cheilcerata ทำให้แมงป่องเหมือนปูโบราณเหล่านี้มีความเกี่ยวข้องกับแมงมุมอย่างใกล้ชิดมากกว่าปู