กระรอกเพศเมียขยายพันธุ์โดยผสมพันธุ์แล้วเกิดเป็นลูก พวกเขาสามารถเริ่มกระบวนการผสมพันธุ์เมื่ออายุหนึ่งปี ฤดูผสมพันธุ์แรกเริ่มในช่วงปลายฤดูหนาว โดยปกติประมาณปลายเดือนกุมภาพันธ์ ฤดูกาลสามารถอยู่ได้จนถึงเดือนพฤษภาคม ฤดูผสมพันธุ์ที่สองเกิดขึ้นในปลายฤดูใบไม้ผลิและคงอยู่จนถึงปลายฤดูร้อน กระรอกส่วนใหญ่มีสองลูกครอก ตอนปลายฤดูใบไม้ผลิและปลายฤดูร้อน บางสายพันธุ์มีเพียงเล็กน้อยปีละครั้ง ลูกกระรอกเรียกว่าลูกแมว
กระรอกตัวเมียมีกลิ่นแรงที่กระรอกตัวผู้สามารถตรวจจับได้ เมื่อกระรอกตัวผู้ได้กลิ่นตัวเมีย เขาจะไล่ตามเธอด้วยความเร็วสูงผ่านต้นไม้ เขาจะตบเปลือกของต้นไม้อย่างดังด้วยอุ้งเท้าของเขา หากมีผู้ชายมากกว่าหนึ่งคนกำลังไล่ตามผู้หญิงคนหนึ่ง ผู้ชายก็มักจะพยายามไล่ตามกันด้วย ส่งผลให้มีการแสดงกายกรรมอันน่าทึ่งผ่านต้นไม้ ตัวเมียจะเลือกตัวผู้ที่แข็งแกร่งที่สุดที่จะผสมพันธุ์ด้วย เธอจะสามารถจำเขาได้ตั้งแต่วันนั้นเป็นต้นไปและจะไม่เจ็บปวดที่จะไม่แต่งงานกับเขาอีก หลังจากผสมพันธุ์แล้วกระรอกตัวผู้ก็ออกไปได้ดี เขาไม่มีส่วนเกี่ยวข้องกับการเลี้ยงลูกแมว
ครอกโดยเฉลี่ยของกระรอกประกอบด้วยลูกแมวสองถึงห้าตัว ระยะเวลาตั้งท้องประมาณหกสัปดาห์ แม้ว่ากระรอกบางสายพันธุ์จะมีระยะเวลาตั้งท้องสั้นเพียงสี่สัปดาห์และบางสายพันธุ์ก็ยาวถึงแปดสัปดาห์ เช่น กระรอกสีเทาและจิ้งจอก
ลูกกระรอกหรือลูกแมวตัวเล็กตั้งแต่แรกเกิด พวกเขามีน้ำหนักประมาณหนึ่งออนซ์และยาวประมาณหนึ่งนิ้ว พวกมันไม่มีขน ไม่มีฟัน และเกือบจะตาบอดในช่วงหนึ่งถึงสองเดือนแรกของชีวิต อย่างไรก็ตาม พวกมันเติบโตอย่างรวดเร็วและมักจะหย่านมอย่างสมบูรณ์เมื่ออายุสิบสัปดาห์ เมื่อพวกมันอายุได้สี่เดือน ลูกกระรอกส่วนใหญ่ได้ออกจากรังของแม่ไปโดยตลอด